More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0050 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 325 aa  674    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.23 
 
 		 323 aa  497  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.92 
 
 		 321 aa  499  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  76 
 
 		 321 aa  497  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.18 
 
 		 319 aa  447  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.49 
 
 		 319 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.94 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 		 319 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  64 
 
 		 321 aa  428  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.3 
 
 		 319 aa  404  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 325 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 321 aa  288  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  43.89 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 341 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 443 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 365 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 435 aa  238  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 434 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 432 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 448 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 448 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 439 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 449 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 453 aa  228  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 455 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 449 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 361 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 449 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 449 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 449 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 449 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 435 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 451 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 436 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 435 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 434 aa  215  8e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 449 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 338 aa  205  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 329 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 346 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 329 aa  198  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  36.17 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>