More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2326 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2326  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000428305  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1032  50S ribosomal protein L3  95.83 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0034  50S ribosomal protein L3  78.12 
 
 		 192 aa  322  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000482612  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0059  50S ribosomal protein L3  79.17 
 
 		 191 aa  315  3e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  6.39539e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1875  50S ribosomal protein L3  76.56 
 
 		 191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.000188213  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0001  50S ribosomal protein L3  76.56 
 
 		 191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000708799  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2081  50S ribosomal protein L3  76.56 
 
 		 191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.00000000000497274  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0084  50S ribosomal protein L3  73.96 
 
 		 191 aa  290  1e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000354525  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1968  50S ribosomal protein L3  69.79 
 
 		 192 aa  286  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000162789  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0286  50S ribosomal protein L3  61.46 
 
 		 191 aa  250  9.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00181466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  37.56 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  37.56 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  38.38 
 
 		 216 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  37.24 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  36.45 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  35.53 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  36.36 
 
 		 216 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  36.14 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  48.08 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  35.83 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  39.09 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  38.97 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  35.5 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  36.45 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  35.68 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  34 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  35.96 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  33.83 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  34.76 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  36.87 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  34 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  31.16 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  38.78 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  34 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  35.86 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  36.95 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  34.76 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  33.84 
 
 		 218 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3804  50S ribosomal protein L3  38.46 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000896818  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  37.06 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3746  50S ribosomal protein L3  38.46 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000021686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2632  50S ribosomal protein L3  38.46 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.000000000488611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3776  50S ribosomal protein L3  38.46 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000325408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  36.08 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1226  50S ribosomal protein L3  37.2 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0600156  unclonable  0.00000985108 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3169  50S ribosomal protein L3  38.46 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000263976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3478  50S ribosomal protein L3  38.46 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.00000000879138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  34.5 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1924  50S ribosomal protein L3  38.46 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000132844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  33.33 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  35.53 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  34.16 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  35.9 
 
 		 219 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  37.63 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  35.05 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  36.32 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  34.18 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  36.92 
 
 		 217 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000108395  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  33.67 
 
 		 217 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0767  50S ribosomal protein L3  34.87 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  35.9 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3068  50S ribosomal protein L3  37.95 
 
 		 219 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000718216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  36.18 
 
 		 220 aa  98.6  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  35.5 
 
 		 212 aa  98.6  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  37.76 
 
 		 209 aa  98.2  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  36.68 
 
 		 290 aa  98.6  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  37.11 
 
 		 209 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  35 
 
 		 213 aa  97.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1795  50S ribosomal protein L3P  36.45 
 
 		 268 aa  98.2  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.170696  normal  0.0358825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3644  50S ribosomal protein L3  35.9 
 
 		 219 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000185363  hitchhiker  0.0000000000200291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0314  50S ribosomal protein L3  35.9 
 
 		 219 aa  97.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138197  hitchhiker  0.00855725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  36.92 
 
 		 279 aa  97.8  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  35.38 
 
 		 220 aa  97.8  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  34.85 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  37.7 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  34 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  37.11 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  33.16 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0323  50S ribosomal protein L3  35.05 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000334047  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  34.98 
 
 		 211 aa  97.1  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  35.5 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  36.55 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  36.55 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  36.08 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  36.22 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  34.55 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  35.45 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  33.5 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  36.55 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1430  50S ribosomal protein L3  34.87 
 
 		 213 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544436  normal  0.0131541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2736  ribosomal protein L3  37 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301212  normal  0.0821652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  36.08 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  36.08 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  36.08 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  36.08 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  36.08 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  32.5 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  36.08 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  36.08 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  36.08 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>