More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1968 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1968  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000162789  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2326  50S ribosomal protein L3  69.79 
 
 		 192 aa  286  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000428305  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1032  50S ribosomal protein L3  69.79 
 
 		 192 aa  286  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0034  50S ribosomal protein L3  68.23 
 
 		 192 aa  280  8.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000482612  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1875  50S ribosomal protein L3  70.83 
 
 		 191 aa  280  9e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.000188213  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2081  50S ribosomal protein L3  70.83 
 
 		 191 aa  280  9e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.00000000000497274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0001  50S ribosomal protein L3  70.83 
 
 		 191 aa  280  9e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000708799  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0286  50S ribosomal protein L3  69.79 
 
 		 191 aa  280  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00181466  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0059  50S ribosomal protein L3  69.27 
 
 		 191 aa  279  2e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  6.39539e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0084  50S ribosomal protein L3  64.58 
 
 		 191 aa  254  8e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000354525  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  40.91 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  40.82 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  38.54 
 
 		 213 aa  127  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  40.82 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  40.82 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  40.8 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  41.84 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  34.01 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  43.75 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  40.84 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  39.79 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0337  50S ribosomal protein L3  39.9 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773756  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  39.49 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  39.49 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  39.29 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  41.58 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  38.66 
 
 		 216 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  40.21 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  41.21 
 
 		 214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  42.41 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  42.41 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  42.41 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  37.77 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  39.79 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  37.76 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  41.03 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1854  50S ribosomal protein L3  39.38 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000292484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  42.63 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  42.63 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  35.94 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  41.75 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  35.42 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  41.88 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  37.56 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  35.42 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  37.82 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  38.07 
 
 		 218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  37.19 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  37.56 
 
 		 215 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  41.36 
 
 		 211 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2688  50S ribosomal protein L3  38.31 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  38.14 
 
 		 212 aa  108  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000199127  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  42.41 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  39.27 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  41.36 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  38.66 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  36.79 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0426  50S ribosomal protein L3  37.63 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000808775  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  38.25 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  40.31 
 
 		 212 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  38.83 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  37.88 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0433  50S ribosomal protein L3  37 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000241052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  38.73 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  38.27 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  38.07 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0494  50S ribosomal protein L3  37 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000368377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  37.11 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  37.31 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  38.97 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06250  50S ribosomal protein L3  40.68 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00608659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  39.79 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  38.5 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2372  ribosomal protein L3  38.86 
 
 		 211 aa  104  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  37.37 
 
 		 217 aa  104  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4544  50S ribosomal protein L3  36.98 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000354089  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  40.91 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0266  ribosomal protein L3  39.08 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000000356629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  38.27 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  37.11 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  37.64 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  37 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  39.29 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000715109  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  38.86 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1956  50S ribosomal protein L3  38.46 
 
 		 238 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00677731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04521  50S ribosomal protein L3  38.66 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000554969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03171  50S ribosomal protein L3  37.31 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00105587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  37.31 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  36.79 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  35.98 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  36.08 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  37.31 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309233  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  37.31 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0698  50S ribosomal protein L3  37.76 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000853628  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0398  ribosomal protein L3  35.35 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  37.95 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  37.31 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  36.22 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  37.31 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>