More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1193 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0032  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  51.19 
 
 		 1033 aa  983    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  37.36 
 
 		 1038 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 		 1031 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2782  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.91 
 
 		 1036 aa  889    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0804863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  53.33 
 
 		 1014 aa  1060    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2065  acriflavin resistance protein  47.32 
 
 		 1027 aa  938    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.824615  normal  0.45428 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  38.6 
 
 		 1012 aa  710    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.35 
 
 		 1024 aa  766    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1638  acriflavin resistance protein  45.33 
 
 		 1047 aa  879    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355465  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  40.77 
 
 		 1040 aa  698    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.75 
 
 		 1030 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0767  acriflavin resistance plasma membrane protein  39.48 
 
 		 1022 aa  687    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5960  acriflavin resistance protein  50.4 
 
 		 1017 aa  988    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.618564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  38.5 
 
 		 1012 aa  706    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1202  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  51.19 
 
 		 1033 aa  983    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00480  multidrug efflux pump  47.52 
 
 		 1040 aa  967    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1031 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  48.91 
 
 		 1029 aa  946    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1581  RND HAE1/HME family protein  51.48 
 
 		 1036 aa  1014    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.76 
 
 		 1031 aa  659    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  53.49 
 
 		 1014 aa  1053    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0891  RND efflux transporter  48.01 
 
 		 1029 aa  959    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668261  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4150  acriflavin resistance protein  46.61 
 
 		 1027 aa  947    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1045  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  51.19 
 
 		 1033 aa  983    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  58.33 
 
 		 1015 aa  1197    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  40.53 
 
 		 1022 aa  775    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  52.77 
 
 		 1014 aa  1049    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  58.53 
 
 		 1015 aa  1201    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1988  acriflavin resistance protein  47.42 
 
 		 1011 aa  906    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  40.34 
 
 		 1025 aa  745    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2737  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  49.65 
 
 		 1026 aa  935    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.917561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2283  acriflavin resistance protein  55.86 
 
 		 1031 aa  1092    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  36.42 
 
 		 1030 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0079  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  51.48 
 
 		 1036 aa  1014    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0201  acriflavin resistance protein  53.02 
 
 		 1028 aa  1076    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0707  acriflavin resistance protein  46.28 
 
 		 1025 aa  955    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  52.69 
 
 		 1009 aa  1053    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2803  RND family multidrug/cation transporter  46.38 
 
 		 1025 aa  902    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2244  AcrB/AcrD/AcrF cation/multidrug efflux pump  47.52 
 
 		 1030 aa  906    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0528  acriflavin resistance protein  52.23 
 
 		 1026 aa  1036    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1155  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 		 1025 aa  888    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  99.8 
 
 		 1019 aa  2067    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1055  acriflavin resistance protein  50.29 
 
 		 686 aa  641    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.393626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  40.29 
 
 		 1064 aa  763    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3678  acriflavin resistance protein  47.32 
 
 		 1027 aa  926    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0090  acriflavin resistance protein  47.16 
 
 		 1020 aa  854    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  54.14 
 
 		 1034 aa  1094    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3699  acriflavin resistance protein  51.04 
 
 		 1029 aa  1016    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.459748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1287  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  51.58 
 
 		 1036 aa  1034    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2236  acriflavin resistance protein  45.43 
 
 		 1047 aa  879    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3649  acriflavin resistance protein  54.72 
 
 		 1035 aa  1074    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1118  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.56 
 
 		 1043 aa  877    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0778165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1651  acriflavin resistance protein  54.39 
 
 		 1026 aa  1095    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3372  acriflavin resistance protein  48.17 
 
 		 1021 aa  903    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2411  acriflavin resistance protein  50.3 
 
 		 1013 aa  987    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.848579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  43.74 
 
 		 1024 aa  818    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1496  acriflavin resistance protein  46.47 
 
 		 1025 aa  904    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  40.45 
 
 		 1051 aa  750    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  53.33 
 
 		 1014 aa  1058    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1587  acriflavin resistance protein  40.16 
 
 		 1019 aa  717    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268577  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0111  acriflavin resistance protein  40.67 
 
 		 1028 aa  789    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  54.82 
 
 		 1034 aa  1128    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3139  acriflavin resistance protein  47.92 
 
 		 1012 aa  952    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389349  normal  0.483157 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  36.45 
 
 		 1031 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  47.62 
 
 		 1026 aa  943    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2699  acriflavin resistance protein  55.17 
 
 		 1029 aa  1092    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  49.21 
 
 		 1029 aa  951    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0357  acriflavin resistance protein  47.5 
 
 		 1030 aa  962    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  53.17 
 
 		 1018 aa  1051    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0929  acriflavin resistance protein  50.25 
 
 		 1033 aa  1018    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  50.6 
 
 		 1026 aa  1028    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 		 1024 aa  896    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  55.83 
 
 		 1032 aa  1152    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 1036 aa  976    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3802  acriflavin resistance protein  46.47 
 
 		 1058 aa  890    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578442  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0465  acriflavin resistance protein  46.58 
 
 		 1025 aa  952    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.471269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0615  cation/multidrug efflux protein  44.89 
 
 		 1038 aa  838    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.74 
 
 		 1068 aa  651    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  36.28 
 
 		 1034 aa  656    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 		 1031 aa  661    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  36.45 
 
 		 1031 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 		 1031 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7711  acriflavin resistance protein  49.65 
 
 		 1017 aa  981    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  36.73 
 
 		 1034 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  100 
 
 		 1019 aa  2069    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09520  RND efflux transporter  47.97 
 
 		 1029 aa  959    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  53.37 
 
 		 1018 aa  1054    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0382  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  51.19 
 
 		 1033 aa  983    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  37.73 
 
 		 1048 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  53.98 
 
 		 1017 aa  1066    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0371  acriflavin resistance protein  47.99 
 
 		 1029 aa  968    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  35.96 
 
 		 1031 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 		 1031 aa  661    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1497  RND HAE1/HME family protein  51.48 
 
 		 1036 aa  1014    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0768  acriflavin resistance protein  46.24 
 
 		 1032 aa  894    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.83 
 
 		 1034 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3269  putative multidrug resistance protein  47.98 
 
 		 1023 aa  971    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1198  RND efflux transporter  39.28 
 
 		 1022 aa  679    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  49.41 
 
 		 1028 aa  977    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1024  acriflavin resistance protein  45.83 
 
 		 1037 aa  899    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>