287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0971 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  74.12 
 
 
186 aa  253  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  70.59 
 
 
174 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  46.71 
 
 
173 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
178 aa  134  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  43.6 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  37.89 
 
 
234 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  38.82 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  38.51 
 
 
181 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  35.26 
 
 
177 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  37.01 
 
 
172 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  38.24 
 
 
180 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  36.99 
 
 
183 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  35.63 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  33.14 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.25 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  27.49 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  30.59 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  32.45 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  32.65 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.75 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.16 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  31.29 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  33.1 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  33.1 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  33.1 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  27.81 
 
 
205 aa  70.9  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  28.9 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.5 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  29.5 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  29.5 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  26.24 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  29.17 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  30.2 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  29.86 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  29.71 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  25.53 
 
 
217 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  23.81 
 
 
190 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  35.14 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.77 
 
 
186 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.55 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  30.58 
 
 
188 aa  61.6  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.63 
 
 
144 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.63 
 
 
144 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  30.63 
 
 
144 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  30.63 
 
 
144 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.63 
 
 
144 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.38 
 
 
236 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  32 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  28.39 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  29.29 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  24.46 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  26.06 
 
 
193 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.73 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.64 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.71 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.07 
 
 
210 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  23.74 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  23.74 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  36.45 
 
 
151 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  27.08 
 
 
180 aa  58.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  23.49 
 
 
213 aa  58.2  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  27.86 
 
 
207 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  28.12 
 
 
179 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.92 
 
 
143 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  31.2 
 
 
144 aa  57.4  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  31.2 
 
 
144 aa  57.4  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  30.51 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  24.85 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  21.09 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  29.32 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  26.75 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  30 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  31.9 
 
 
143 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  26.75 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.93 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  26.75 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.82 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  27.5 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.82 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.13 
 
 
143 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  33.93 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.43 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.53 
 
 
283 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.55 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.82 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.82 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.82 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  32.43 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.86 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1184  alkylhydroperoxidase  34.95 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.58 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.84 
 
 
184 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  26.11 
 
 
184 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>