More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2745 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  100 
 
 
191 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  83.25 
 
 
191 aa  322  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  80.63 
 
 
191 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  64.16 
 
 
175 aa  224  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  64.88 
 
 
175 aa  222  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  64.16 
 
 
179 aa  211  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  44.64 
 
 
177 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  44.64 
 
 
177 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  44.05 
 
 
177 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  44.05 
 
 
177 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  44.05 
 
 
177 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  44.05 
 
 
177 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  44.05 
 
 
177 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  44.05 
 
 
177 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  42.01 
 
 
176 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  37.63 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  37.16 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.42 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  38.71 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  34.71 
 
 
174 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  38.17 
 
 
186 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  38.17 
 
 
186 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  38.17 
 
 
186 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  38.73 
 
 
186 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  39.08 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.5 
 
 
186 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  40.12 
 
 
184 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  37.22 
 
 
188 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  37.63 
 
 
186 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.63 
 
 
188 aa  104  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.79 
 
 
184 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  37.93 
 
 
186 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  36.63 
 
 
189 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  34.12 
 
 
178 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  33.9 
 
 
188 aa  98.6  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  41.28 
 
 
206 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  34.66 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  33.33 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  32.97 
 
 
180 aa  94.7  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  35.57 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  33.72 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.87 
 
 
186 aa  91.7  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  33.86 
 
 
441 aa  91.3  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  32.75 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  32.42 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  33.15 
 
 
208 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  36.13 
 
 
190 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  34.52 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.8 
 
 
222 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  35.03 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  29.38 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  31.67 
 
 
184 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  41.11 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  29.61 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  32.39 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  32.8 
 
 
199 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  33.93 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  29.28 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  28.65 
 
 
181 aa  85.9  4e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  31.07 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  31.28 
 
 
182 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  32.24 
 
 
193 aa  84.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  34.29 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.33 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  37.57 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  35.06 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  28.65 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  32.16 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  31.21 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  37.22 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  34.32 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  38.89 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  37.99 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  33.15 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  30.05 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  33.51 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  33.33 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  31.84 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  34.68 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  34.29 
 
 
420 aa  78.6  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  31.89 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  35.42 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  31.22 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  25.14 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  31.25 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  34.32 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  30.34 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  34.91 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  31.95 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  28.81 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  35.2 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  31.28 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  31.29 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  29.24 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  33.15 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  33.33 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  33.33 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  31.22 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  31.58 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  30.64 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>