More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0979 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  620  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  67.88 
 
 		 432 aa  448  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  66.11 
 
 		 309 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  66.78 
 
 		 304 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  60.2 
 
 		 300 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  58.8 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  56.67 
 
 		 300 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  54.82 
 
 		 301 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  53 
 
 		 317 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  52 
 
 		 332 aa  338  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 301 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 314 aa  329  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 314 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 301 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  49.17 
 
 		 305 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  49.17 
 
 		 305 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  48.49 
 
 		 321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 331 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 308 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5290  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 316 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.79 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  209  7e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3156  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1550  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2243  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2448  transcriptional regulator, LysR family  37.15 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01658  transcriptional regulator transcription regulator protein  36.15 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  35.12 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4508  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  0.61755 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 345 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 306 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2055  transcriptional regulator, LysR family  37.15 
 
 		 325 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5507  transcriptional regulator, LysR family  37.91 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242052  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5527  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5891  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384931  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6400  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5308  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  36.77 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  36.77 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  34.48 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1024  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.849003  normal  0.711621 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6126  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2206  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6242  LysR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6527  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6019  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176233  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64780  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5625  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1942  LysR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000680141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>