More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5782 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 454 aa  909    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4107  major facilitator superfamily MFS_1  70.95 
 
 		 458 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  37.65 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  38.69 
 
 		 447 aa  264  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 439 aa  259  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  34.36 
 
 		 466 aa  256  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 461 aa  256  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  34.98 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.66 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  36.12 
 
 		 463 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  34.96 
 
 		 444 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  34.94 
 
 		 456 aa  252  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  34.53 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 628 aa  251  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  39.47 
 
 		 459 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  36.29 
 
 		 444 aa  249  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  34.66 
 
 		 446 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  34.24 
 
 		 461 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  34.24 
 
 		 461 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  34.17 
 
 		 484 aa  249  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  34.24 
 
 		 461 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 441 aa  249  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  36.99 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  37.14 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 		 461 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 		 461 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  35.6 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  35.1 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  35.91 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  35.91 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  35.91 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 426 aa  243  7e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.04 
 
 		 437 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 445 aa  242  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 452 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  33.26 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  34.77 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  36 
 
 		 442 aa  240  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  34.25 
 
 		 459 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  34.75 
 
 		 460 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  34.41 
 
 		 468 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 439 aa  239  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 461 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  35.16 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  34.88 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  35.37 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  34.73 
 
 		 457 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 444 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 439 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 457 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  34.5 
 
 		 435 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  34.5 
 
 		 435 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  33.04 
 
 		 482 aa  236  8e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  35.66 
 
 		 449 aa  236  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  33.26 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.1 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  34.75 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 450 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  35.46 
 
 		 439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 453 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.43 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  34.5 
 
 		 435 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  34.5 
 
 		 435 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>