More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7720 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  100 
 
 		 304 aa  618  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  76.24 
 
 		 304 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  73.68 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  69.08 
 
 		 320 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  70.39 
 
 		 304 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  70.2 
 
 		 342 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  68.75 
 
 		 304 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  68.42 
 
 		 326 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  69.41 
 
 		 304 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  68.65 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  69.08 
 
 		 373 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  67.76 
 
 		 344 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  68.75 
 
 		 304 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  68.42 
 
 		 304 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  68.75 
 
 		 304 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  67.76 
 
 		 304 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  67.76 
 
 		 306 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  67.76 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  67.76 
 
 		 304 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  67.76 
 
 		 304 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  67.76 
 
 		 304 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  67.76 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  70.39 
 
 		 304 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  67.33 
 
 		 308 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  64.92 
 
 		 321 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  65.25 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  64.92 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  61.59 
 
 		 303 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  62.58 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  56.11 
 
 		 314 aa  351  8.999999999999999e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  54.39 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  51.8 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  51.45 
 
 		 313 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  57.34 
 
 		 301 aa  318  5e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  53.69 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  50.32 
 
 		 314 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  52.9 
 
 		 309 aa  310  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  53.72 
 
 		 312 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  52.63 
 
 		 323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  54.49 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  52.96 
 
 		 311 aa  297  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  51.75 
 
 		 315 aa  295  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  49.01 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  47.85 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  47.71 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  47.71 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 311 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  48.36 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  48.03 
 
 		 339 aa  266  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  45.1 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  44.59 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  47.56 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  49.17 
 
 		 317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  47.78 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  45.3 
 
 		 293 aa  256  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  47.12 
 
 		 312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  47.35 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.81 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  45.6 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  43.85 
 
 		 310 aa  248  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  46.13 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  44.52 
 
 		 323 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  45.45 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  47.16 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  43.46 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  42.43 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  42.12 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  45.12 
 
 		 332 aa  228  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  40.33 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  38.64 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  41.47 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  40.57 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.52 
 
 		 320 aa  211  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  40.4 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  37.3 
 
 		 308 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  41.53 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  38.74 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  40.07 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  38.78 
 
 		 300 aa  205  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.84 
 
 		 319 aa  205  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.31 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.02 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.83 
 
 		 316 aa  201  9e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 		 308 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.05 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.61 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.91 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  39.07 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  38.08 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.53 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 305 aa  196  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  38.91 
 
 		 316 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.69 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>