More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4853 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 493 aa  979    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  42.52 
 
 		 485 aa  303  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  37.42 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  39.78 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  34.78 
 
 		 487 aa  272  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  37.76 
 
 		 485 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  35.67 
 
 		 486 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  34.95 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  32.43 
 
 		 479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  32.43 
 
 		 479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  35.63 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  34.66 
 
 		 495 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  36.05 
 
 		 484 aa  232  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  34.59 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  36.53 
 
 		 498 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  36.22 
 
 		 492 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  38.92 
 
 		 483 aa  216  9e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  36.17 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  32.29 
 
 		 510 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  32.76 
 
 		 490 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  34.16 
 
 		 510 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  34.37 
 
 		 464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  34.86 
 
 		 488 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  31.46 
 
 		 509 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  34.62 
 
 		 513 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  31.16 
 
 		 504 aa  207  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 485 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  34.38 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  34.38 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  34.38 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  34.34 
 
 		 497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 491 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 		 527 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  30.27 
 
 		 481 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  31.74 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  30.28 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  32.79 
 
 		 496 aa  172  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 		 474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  28.84 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  30.52 
 
 		 504 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 		 507 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 475 aa  104  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 456 aa  90.9  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 461 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  24.94 
 
 		 461 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  24.77 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  24.72 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  24.72 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  24.72 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  24.72 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 492 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  28.1 
 
 		 449 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 461 aa  87  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  25.11 
 
 		 461 aa  86.7  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 449 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27.09 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  26.24 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  22.87 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  24.48 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  25.72 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.78 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  24.57 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  25.86 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 502 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 453 aa  72  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  28.29 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  22.52 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  22.52 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>