More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2029 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 358 aa  725    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  57.95 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  53.45 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  53.45 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  53.22 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 361 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  54.89 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  56.97 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  54.02 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  54.04 
 
 		 359 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  54.04 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  52.56 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  51.26 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  51.53 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  52.22 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  52.37 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  55.38 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  55.26 
 
 		 360 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  57.42 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  51.96 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  52.91 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 363 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  54.15 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  54.77 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  53.17 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  54.15 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  56.78 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  54.77 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  53.17 
 
 		 377 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  52.37 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1547  peptide chain release factor 1  52.37 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891695  normal  0.256018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  52.37 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  51.53 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  54.77 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  53.33 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  54.77 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  53.64 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1363  peptide chain release factor 1  52.37 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133324  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1971  peptide chain release factor 1  52.37 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00228451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  54.77 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  54.77 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1907  peptide chain release factor 1  52.37 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0341026  normal  0.709349 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  52.09 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  54.46 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  54.46 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  54.46 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  54.46 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>