83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4339 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  100 
 
 
393 aa  756    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  77.41 
 
 
394 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  77.41 
 
 
394 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  76.4 
 
 
394 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  77.86 
 
 
393 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  77.61 
 
 
393 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  76.4 
 
 
394 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  51.88 
 
 
395 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  53.16 
 
 
388 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  53.16 
 
 
388 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  47 
 
 
388 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  41.85 
 
 
398 aa  236  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2513  hypothetical protein  30.12 
 
 
621 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  26.28 
 
 
702 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  26.28 
 
 
702 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  30 
 
 
499 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  41.84 
 
 
664 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  30.51 
 
 
200 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  29.7 
 
 
156 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  29.73 
 
 
209 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  34.58 
 
 
190 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  30.15 
 
 
546 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  34.58 
 
 
642 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  34.58 
 
 
642 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  26.47 
 
 
207 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  34.55 
 
 
254 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  33.64 
 
 
640 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  34.58 
 
 
640 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  32.2 
 
 
645 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  26.53 
 
 
329 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  29.81 
 
 
190 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  29.91 
 
 
190 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  28.42 
 
 
155 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  25 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  34.07 
 
 
220 aa  49.7  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  28 
 
 
193 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  28.71 
 
 
194 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  30.58 
 
 
647 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  31.71 
 
 
190 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  28.93 
 
 
647 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  27.97 
 
 
203 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  31.68 
 
 
195 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  31.78 
 
 
642 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  28.93 
 
 
636 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  23.47 
 
 
151 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  33 
 
 
176 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  34.69 
 
 
633 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  26 
 
 
213 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  36.76 
 
 
644 aa  47  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  25.47 
 
 
218 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  28.69 
 
 
138 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  36.45 
 
 
643 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  31.52 
 
 
293 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  30.63 
 
 
632 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3996  cytochrome c, class I  35.05 
 
 
143 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2513  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  30.91 
 
 
143 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  27.27 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  29.73 
 
 
632 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  27.03 
 
 
631 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  29.52 
 
 
629 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  33.67 
 
 
652 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30 
 
 
498 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  34.83 
 
 
166 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  30.58 
 
 
683 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  38.3 
 
 
649 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  27.17 
 
 
184 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  34.18 
 
 
254 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  41.82 
 
 
313 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  24.05 
 
 
314 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.81 
 
 
575 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  30.89 
 
 
166 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  25.24 
 
 
205 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3264  c-type cytochrome  34.02 
 
 
143 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0393  hypothetical protein  27.48 
 
 
136 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789834  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6117  cytochrome c protein CopJ  29.73 
 
 
174 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0965626  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3596  hypothetical protein  31.13 
 
 
144 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.705754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  29 
 
 
201 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  35.9 
 
 
438 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  31.03 
 
 
181 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  41.82 
 
 
309 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  27.17 
 
 
248 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  29.79 
 
 
177 aa  43.1  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>