19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0393 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0393  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  282  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789834  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0081  hypothetical protein  42.74 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.824718 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1186  hypothetical protein  39.52 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222804  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4164  hypothetical protein  42.45 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.277093  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2694  putative cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.97531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0404  hypothetical protein  37.62 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2431  class I monoheme cytochrome c  34.65 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0928963  normal  0.0529755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0775  class I monoheme cytochrome c  34.65 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  34.12 
 
 		 388 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  34.12 
 
 		 388 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  44 
 
 		 254 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  27.48 
 
 		 393 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  51.43 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 388 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0749  hypothetical protein  32.14 
 
 		 166 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4942  hypothetical protein  35 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140936  unclonable  0.0000158871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3426  hypothetical protein  35 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  37.29 
 
 		 702 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  37.29 
 
 		 702 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>