More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4030 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  100 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  95.24 
 
 
296 aa  544  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  95.24 
 
 
296 aa  544  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  95.92 
 
 
296 aa  545  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  95.58 
 
 
296 aa  542  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  94.56 
 
 
296 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  94.56 
 
 
296 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  94.56 
 
 
296 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  94.56 
 
 
296 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  94.56 
 
 
296 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  85.19 
 
 
297 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  60.94 
 
 
297 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  57.91 
 
 
297 aa  350  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  47.75 
 
 
294 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  48.31 
 
 
312 aa  266  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  47.6 
 
 
300 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  48.12 
 
 
295 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  46.62 
 
 
307 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  46.05 
 
 
300 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  46.78 
 
 
301 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  46.39 
 
 
300 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  45.36 
 
 
299 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  54.03 
 
 
290 aa  255  5e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  47.44 
 
 
295 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  47.6 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  44.75 
 
 
309 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  44.75 
 
 
309 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  46.23 
 
 
299 aa  251  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  45.89 
 
 
299 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  45.61 
 
 
306 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  44.41 
 
 
320 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  47.84 
 
 
297 aa  246  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  48.97 
 
 
290 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  49.62 
 
 
295 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  46.77 
 
 
294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  44.14 
 
 
316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  46.13 
 
 
296 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  44.19 
 
 
297 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  46.64 
 
 
293 aa  236  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  51.72 
 
 
295 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  42.61 
 
 
309 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  48.81 
 
 
297 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  44.15 
 
 
293 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  44.15 
 
 
293 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  46.34 
 
 
290 aa  235  8e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  45.18 
 
 
306 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  51.36 
 
 
297 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  44.52 
 
 
337 aa  230  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  47.18 
 
 
290 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  45.93 
 
 
290 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  48.24 
 
 
294 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  47.26 
 
 
297 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  47.26 
 
 
296 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.23 
 
 
296 aa  226  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  47.94 
 
 
301 aa  226  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  46.92 
 
 
297 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  45.59 
 
 
296 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  46.76 
 
 
296 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  45.21 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  41.1 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  44.44 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  42.86 
 
 
296 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  42.12 
 
 
294 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  43.32 
 
 
308 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  43.56 
 
 
334 aa  216  5e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  45.15 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  44.84 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  44.06 
 
 
299 aa  212  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  43.6 
 
 
308 aa  211  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  43.32 
 
 
308 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  44.91 
 
 
299 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  46.08 
 
 
287 aa  209  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  46.48 
 
 
295 aa  209  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  45.82 
 
 
290 aa  208  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  41.58 
 
 
299 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  43.32 
 
 
308 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  41.78 
 
 
298 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  45.6 
 
 
297 aa  206  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  41.16 
 
 
321 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  41.67 
 
 
306 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  41.67 
 
 
306 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  41.83 
 
 
293 aa  205  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  41.73 
 
 
291 aa  205  7e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  39.93 
 
 
307 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  41.79 
 
 
291 aa  205  9e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  41.44 
 
 
293 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  47.17 
 
 
295 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  42.11 
 
 
305 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  39.59 
 
 
297 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  41.44 
 
 
293 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  40.59 
 
 
308 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  41.44 
 
 
293 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  41.44 
 
 
293 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  39.79 
 
 
293 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  47.31 
 
 
295 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  43.75 
 
 
299 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  47.31 
 
 
295 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  37.69 
 
 
335 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  42.21 
 
 
293 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  43.6 
 
 
298 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>