More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0875 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0875  porin  100 
 
 
386 aa  766  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  100 
 
 
386 aa  766  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  90.67 
 
 
386 aa  686  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  94.82 
 
 
386 aa  733  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  99.74 
 
 
386 aa  765  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  95.6 
 
 
386 aa  739  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  95.6 
 
 
386 aa  739  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  75.41 
 
 
388 aa  562  1e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  68.11 
 
 
523 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  67.85 
 
 
385 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  67.13 
 
 
384 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  67.13 
 
 
384 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  67.13 
 
 
430 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  67.13 
 
 
384 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  67.13 
 
 
430 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  67.13 
 
 
411 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  67.13 
 
 
384 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  64.72 
 
 
394 aa  470  1e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  64.56 
 
 
386 aa  465  1e-130  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  65.94 
 
 
385 aa  465  1e-130  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  65.94 
 
 
385 aa  465  1e-130  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  65.4 
 
 
385 aa  467  1e-130  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  65.12 
 
 
385 aa  468  1e-130  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  65.67 
 
 
385 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  61.26 
 
 
386 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  59.44 
 
 
387 aa  438  1e-122  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  59.8 
 
 
393 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  61.06 
 
 
393 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  61.56 
 
 
386 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  60.26 
 
 
386 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  62.02 
 
 
386 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  62.02 
 
 
386 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  61.92 
 
 
386 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  56.09 
 
 
390 aa  415  1e-115  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  59.07 
 
 
404 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  56.27 
 
 
390 aa  406  1e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  56.89 
 
 
430 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  56.63 
 
 
430 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  57 
 
 
430 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  56.63 
 
 
430 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  57.95 
 
 
390 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  56.27 
 
 
390 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  56.89 
 
 
430 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  56.63 
 
 
430 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  56.63 
 
 
390 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  57.88 
 
 
390 aa  400  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  57.34 
 
 
390 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  57.34 
 
 
390 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  57.34 
 
 
390 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  54.01 
 
 
376 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  54.01 
 
 
376 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  54.01 
 
 
376 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  51.93 
 
 
389 aa  356  3e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  54.26 
 
 
376 aa  355  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  47.7 
 
 
421 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  47.7 
 
 
421 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  46.37 
 
 
397 aa  306  5e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  47.45 
 
 
397 aa  305  1e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  44.67 
 
 
399 aa  303  3e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  44.67 
 
 
399 aa  303  3e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  44.67 
 
 
399 aa  303  3e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  44.67 
 
 
399 aa  303  3e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  47.48 
 
 
445 aa  303  5e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  44.67 
 
 
399 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  46.31 
 
 
436 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  45.57 
 
 
391 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  44.86 
 
 
397 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.55 
 
 
436 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  45.73 
 
 
389 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45.55 
 
 
386 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45.55 
 
 
386 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45.55 
 
 
386 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45.55 
 
 
386 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45.55 
 
 
386 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.66 
 
 
385 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.66 
 
 
385 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  45.29 
 
 
386 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  44.11 
 
 
397 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  45.61 
 
 
397 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.15 
 
 
383 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  45.15 
 
 
383 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.15 
 
 
383 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  44.9 
 
 
383 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  46.03 
 
 
389 aa  282  6e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  45.77 
 
 
389 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  43.01 
 
 
378 aa  273  5e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  44.42 
 
 
400 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  43.42 
 
 
391 aa  266  6e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  43.36 
 
 
389 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  9.90839e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  45.6 
 
 
381 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  42.96 
 
 
395 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  44.17 
 
 
400 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  44.76 
 
 
402 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  45.01 
 
 
380 aa  254  2e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  44.65 
 
 
403 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  43.1 
 
 
395 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  44.03 
 
 
380 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  39.8 
 
 
394 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  37.44 
 
 
422 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  43.1 
 
 
395 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>