More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5188 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5188  porin  100 
 
 
381 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  49.18 
 
 
376 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  48.91 
 
 
376 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  48.91 
 
 
376 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  48.6 
 
 
376 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  46.43 
 
 
386 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  44.86 
 
 
393 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  44.19 
 
 
386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  44.19 
 
 
386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  44.19 
 
 
386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  43.93 
 
 
386 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  43.53 
 
 
385 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  44.05 
 
 
393 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  45.33 
 
 
386 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  45.33 
 
 
386 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  43.6 
 
 
387 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  42.56 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  42.45 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  43.06 
 
 
430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  43.06 
 
 
430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  43.06 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  44.54 
 
 
390 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  43.72 
 
 
390 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  43.06 
 
 
411 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  43.06 
 
 
384 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  43.06 
 
 
384 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  43.06 
 
 
384 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  44.05 
 
 
390 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  42.56 
 
 
390 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  44.3 
 
 
430 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  44.05 
 
 
430 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  44.05 
 
 
430 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  44.05 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  44.05 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  44.05 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  43.6 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  43.6 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  42.54 
 
 
385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  42.27 
 
 
385 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  43.32 
 
 
390 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  43.87 
 
 
394 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  43.49 
 
 
385 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  43.49 
 
 
385 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  42.42 
 
 
523 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  43.21 
 
 
385 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  42.42 
 
 
388 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  40.42 
 
 
404 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  40.33 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  42.04 
 
 
386 aa  248  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  41.03 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  41.86 
 
 
386 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  40.11 
 
 
386 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  39.78 
 
 
386 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  41.87 
 
 
386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  41.87 
 
 
386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  38.38 
 
 
397 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  36.77 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  36.77 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  36.77 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  36.77 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  37.63 
 
 
421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  37.63 
 
 
421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  37.91 
 
 
408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  37.71 
 
 
397 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  36.68 
 
 
397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  36.87 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  36.86 
 
 
436 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  36.77 
 
 
399 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  35.91 
 
 
397 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  35.43 
 
 
394 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  36.6 
 
 
386 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  36.51 
 
 
391 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  36.6 
 
 
436 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  36.6 
 
 
386 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  36.6 
 
 
386 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  36.6 
 
 
386 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  36.6 
 
 
386 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  36.34 
 
 
386 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  37.3 
 
 
445 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  36.53 
 
 
383 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  36.53 
 
 
383 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  36.1 
 
 
383 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  36.32 
 
 
385 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  36.32 
 
 
385 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  36.01 
 
 
383 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  37.07 
 
 
395 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  34.86 
 
 
389 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  37.03 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  35.96 
 
 
389 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  38.41 
 
 
398 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  38.41 
 
 
398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  36.95 
 
 
391 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  34.62 
 
 
378 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  38.76 
 
 
352 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  37.2 
 
 
395 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  36.67 
 
 
383 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  36.28 
 
 
395 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  36.89 
 
 
394 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  37.2 
 
 
395 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  35.48 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>