More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2173 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  458  1e-128  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  80.63 
 
 
222 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  77.36 
 
 
226 aa  353  8e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  74.65 
 
 
226 aa  343  9e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  66.98 
 
 
224 aa  311  6e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  58.37 
 
 
224 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  59.62 
 
 
221 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  57.75 
 
 
232 aa  263  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  56.81 
 
 
249 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  57.62 
 
 
221 aa  245  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  56.04 
 
 
218 aa  238  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  47.98 
 
 
219 aa  191  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  50.5 
 
 
245 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  46.31 
 
 
231 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  44.33 
 
 
232 aa  165  7e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  43.84 
 
 
236 aa  162  4e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  45.37 
 
 
233 aa  151  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  43.79 
 
 
194 aa  144  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  41.38 
 
 
215 aa  139  4e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 
232 aa  134  1e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 
236 aa  128  8e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  35.51 
 
 
227 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  41.21 
 
 
225 aa  121  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
224 aa  118  8e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  115  4e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  34.85 
 
 
235 aa  114  1e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  114  2e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 
236 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
216 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  37.06 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 
233 aa  88.6  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 
223 aa  84.3  1e-15  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.68 
 
 
226 aa  83.2  3e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 
239 aa  83.2  3e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 
209 aa  82.4  5e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 
227 aa  82.4  5e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  33.75 
 
 
222 aa  80.9  1e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 
244 aa  80.1  2e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  9.51338e-07 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
265 aa  80.5  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
222 aa  80.5  2e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 
229 aa  79.7  3e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
232 aa  79.3  4e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  30.77 
 
 
227 aa  79.3  4e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
267 aa  78.2  1e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 
220 aa  77  2e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
241 aa  76.6  2e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  9.72767e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
231 aa  76.3  3e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
228 aa  76.3  4e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 
223 aa  75.9  5e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
223 aa  75.9  5e-13  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
228 aa  75.5  6e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 
249 aa  75.5  6e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
233 aa  75.1  7e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
235 aa  74.3  1e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
222 aa  74.3  1e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
226 aa  74.3  1e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
224 aa  73.9  2e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
396 aa  73.9  2e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 
219 aa  74.3  2e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 
238 aa  73.6  2e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
232 aa  72.8  4e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.56 
 
 
231 aa  72.4  5e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  35.33 
 
 
222 aa  72  6e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 
240 aa  72  6e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
231 aa  71.2  1e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
231 aa  71.2  1e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
231 aa  71.2  1e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
231 aa  71.2  1e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
231 aa  71.2  1e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
231 aa  71.2  1e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
231 aa  71.2  1e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
235 aa  70.5  2e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
230 aa  70.5  2e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 
232 aa  70.5  2e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
232 aa  70.5  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 
260 aa  70.1  2e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
222 aa  69.7  3e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3141  GntR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
229 aa  70.1  3e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167888  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
227 aa  70.1  3e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
229 aa  70.1  3e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2643  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
206 aa  69.3  4e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.577807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.46 
 
 
229 aa  69.3  4e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
217 aa  68.9  5e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
260 aa  68.9  5e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
226 aa  68.9  5e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
227 aa  68.9  5e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
254 aa  68.9  6e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
230 aa  68.9  6e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
234 aa  68.9  6e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
242 aa  68.6  7e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
223 aa  68.6  7e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
233 aa  68.6  7e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
231 aa  68.6  7e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
229 aa  68.6  7e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
241 aa  68.6  7e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17475e-07 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
242 aa  68.2  9e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
234 aa  68.2  9e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>