86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0043 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  100 
 
 
316 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  100 
 
 
131 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  100 
 
 
131 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  100 
 
 
313 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  100 
 
 
313 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  100 
 
 
313 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  100 
 
 
313 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  78.63 
 
 
316 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  83.74 
 
 
313 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  81.3 
 
 
312 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  72.13 
 
 
352 aa  188  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  70.73 
 
 
357 aa  186  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  70.73 
 
 
324 aa  184  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  71.54 
 
 
312 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  70.49 
 
 
350 aa  181  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  70.73 
 
 
316 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  67.18 
 
 
315 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  70.83 
 
 
322 aa  177  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  64.71 
 
 
353 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  62.6 
 
 
332 aa  164  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  65.79 
 
 
308 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  64.04 
 
 
308 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  58.09 
 
 
372 aa  157  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  58.87 
 
 
368 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  60.94 
 
 
366 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  66.37 
 
 
304 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  58.06 
 
 
362 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  66.96 
 
 
310 aa  153  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  64.6 
 
 
304 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  62.71 
 
 
303 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  60.16 
 
 
363 aa  151  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  64.04 
 
 
306 aa  150  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  64.6 
 
 
303 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  65.79 
 
 
307 aa  146  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  64.91 
 
 
307 aa  146  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  61.02 
 
 
303 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  59.65 
 
 
304 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  62.28 
 
 
296 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  61.61 
 
 
299 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  55 
 
 
407 aa  140  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  56.9 
 
 
304 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  62.83 
 
 
302 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  68.04 
 
 
302 aa  137  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  60.83 
 
 
415 aa  133  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  52.46 
 
 
343 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.64 
 
 
300 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  50.44 
 
 
304 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  44.72 
 
 
371 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.17 
 
 
406 aa  110  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  50.43 
 
 
323 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  51.28 
 
 
328 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  50.86 
 
 
327 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  46.09 
 
 
295 aa  107  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  51.28 
 
 
328 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  43.17 
 
 
318 aa  103  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  41.67 
 
 
310 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  43.75 
 
 
342 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  45.92 
 
 
286 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  48.45 
 
 
281 aa  90.5  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  39.83 
 
 
325 aa  90.5  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  44.55 
 
 
281 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  46.39 
 
 
287 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  42.06 
 
 
340 aa  88.2  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  43.86 
 
 
314 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  39.82 
 
 
338 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  44.55 
 
 
281 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  36.04 
 
 
338 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  39.64 
 
 
338 aa  84.3  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  34.96 
 
 
351 aa  83.6  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  38.74 
 
 
338 aa  83.6  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  46 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  37.5 
 
 
533 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.76 
 
 
306 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  43.48 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  37.07 
 
 
545 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  29.77 
 
 
340 aa  70.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  34.88 
 
 
339 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  46.67 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  37.23 
 
 
340 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2030  hypothetical protein  57.14 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  29.57 
 
 
398 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.85 
 
 
581 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.42 
 
 
307 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.7 
 
 
302 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2345  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.83 
 
 
286 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0169935  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.68 
 
 
334 aa  40  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>