More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B2193 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
296 aa  617  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  90.88 
 
 
296 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  90.54 
 
 
296 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  90.2 
 
 
296 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  89.53 
 
 
296 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  89.53 
 
 
296 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  89.19 
 
 
296 aa  557  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  89.86 
 
 
296 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  89.53 
 
 
296 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  89.53 
 
 
296 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  28.44 
 
 
326 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
288 aa  149  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  31.19 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  31.21 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  28.19 
 
 
308 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  30.54 
 
 
283 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 
289 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 
283 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  29.97 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  29.59 
 
 
300 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  31.27 
 
 
288 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  30.64 
 
 
289 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  27.84 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  28.32 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  28.14 
 
 
289 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  28.32 
 
 
288 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 
293 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 
293 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 
293 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 
279 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  27.97 
 
 
288 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 
286 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 
279 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  27.8 
 
 
289 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  30.48 
 
 
286 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 
288 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 
286 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  27.55 
 
 
288 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  28.23 
 
 
289 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  28.47 
 
 
265 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 
294 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  24.92 
 
 
284 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
436 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  24.68 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  24.05 
 
 
310 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 
289 aa  92.4  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  23.66 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  45.54 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  25.23 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  25.34 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  45.54 
 
 
307 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 
300 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  26.85 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 
300 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 
300 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  26.75 
 
 
300 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 
300 aa  85.9  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  24.5 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  24.59 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  33.65 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  33.98 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  37.38 
 
 
343 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  25.25 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 
336 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  36.36 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 
168 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>