More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A4454 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4454  shikimate 5-dehydrogenase  100 
 
 
277 aa  569  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.809096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0783  shikimate 5-dehydrogenase  97.11 
 
 
277 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000231913  hitchhiker  4.96147e-05 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4080  shikimate 5-dehydrogenase  93.86 
 
 
277 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4232  shikimate 5-dehydrogenase  92.78 
 
 
277 aa  527  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4415  shikimate 5-dehydrogenase  92.78 
 
 
277 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4070  shikimate 5-dehydrogenase  92.78 
 
 
277 aa  528  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000710125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4356  shikimate 5-dehydrogenase  93.14 
 
 
277 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4467  shikimate 5-dehydrogenase  92.78 
 
 
277 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00323757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4561  shikimate 5-dehydrogenase  92.36 
 
 
308 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.120804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4185  shikimate 5-dehydrogenase  86.28 
 
 
277 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3060  shikimate 5-dehydrogenase  79.06 
 
 
277 aa  461  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2458  shikimate 5-dehydrogenase  60.65 
 
 
277 aa  357  1e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.34489e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0993  shikimate 5-dehydrogenase  57.09 
 
 
276 aa  306  4e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0183  shikimate 5-dehydrogenase  46.79 
 
 
280 aa  228  7e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0450  shikimate 5-dehydrogenase  45.65 
 
 
278 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0121036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0923  shikimate dehydrogenase  46.98 
 
 
280 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1719  shikimate 5-dehydrogenase  46.43 
 
 
279 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.049913  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1163  shikimate 5-dehydrogenase  43.96 
 
 
269 aa  220  2e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1503  shikimate 5-dehydrogenase  43.98 
 
 
284 aa  219  4e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0550  shikimate 5-dehydrogenase  42.09 
 
 
273 aa  215  6e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0743  shikimate 5-dehydrogenase  45.05 
 
 
280 aa  213  2e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2746  shikimate 5-dehydrogenase  45.82 
 
 
288 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0290691  normal  0.306598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0854  shikimate dehydrogenase  41.3 
 
 
298 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1653  shikimate 5-dehydrogenase  42.49 
 
 
268 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1688  shikimate 5-dehydrogenase  42.49 
 
 
268 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.8714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05960  shikimate 5-dehydrogenase  39.55 
 
 
289 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1018  shikimate 5-dehydrogenase  41.24 
 
 
291 aa  200  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0663  shikimate 5-dehydrogenase  39.78 
 
 
294 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0656  shikimate 5-dehydrogenase  43.82 
 
 
297 aa  199  4e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323596  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1998  shikimate dehydrogenase  45.09 
 
 
269 aa  197  1e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3537  shikimate 5-dehydrogenase  43.68 
 
 
295 aa  197  2e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.784567  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0253  shikimate 5-dehydrogenase  43.21 
 
 
284 aa  196  5e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1303  shikimate 5-dehydrogenase  40.73 
 
 
279 aa  193  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00894856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2150  shikimate 5-dehydrogenase-like oxidoreductase  41.89 
 
 
283 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0524  shikimate 5-dehydrogenase  37.41 
 
 
290 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1154  shikimate 5-dehydrogenase  39.5 
 
 
298 aa  189  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1392  shikimate dehydrogenase  41.73 
 
 
286 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.975798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0690  shikimate 5-dehydrogenase  38.83 
 
 
288 aa  189  6e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1558  shikimate dehydrogenase  44.77 
 
 
295 aa  189  6e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1630  shikimate 5-dehydrogenase  39.93 
 
 
290 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2596  shikimate 5-dehydrogenase  40.29 
 
 
290 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0442  shikimate 5-dehydrogenase  39.46 
 
 
286 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.437298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2683  shikimate 5-dehydrogenase  39.64 
 
 
289 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.905975  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0465  shikimate 5-dehydrogenase  38.7 
 
 
286 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3109  shikimate 5-dehydrogenase  38.21 
 
 
286 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3564  shikimate dehydrogenase  38.99 
 
 
279 aa  185  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3106  shikimate 5-dehydrogenase  37.54 
 
 
289 aa  183  2e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1889  shikimate 5-dehydrogenase  39.85 
 
 
288 aa  183  2e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1054  shikimate 5-dehydrogenase  38.81 
 
 
275 aa  182  4e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_408  shikimate 5-dehydrogenase  38.7 
 
 
286 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1168  shikimate dehydrogenase  39.29 
 
 
274 aa  179  5e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2736  shikimate 5-dehydrogenase  38.11 
 
 
298 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1504  quinate/shikimate dehydrogenase  38.21 
 
 
288 aa  175  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2408  quinate/shikimate dehydrogenase  38.21 
 
 
288 aa  175  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.419065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1773  quinate/shikimate dehydrogenase  38.21 
 
 
288 aa  175  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1939  quinate/shikimate dehydrogenase  38.21 
 
 
288 aa  175  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737953 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1950  Quinate/shikimate dehydrogenase  38.21 
 
 
288 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.210326  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1895  quinate/shikimate dehydrogenase  38.21 
 
 
288 aa  175  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01650  hypothetical protein  38.21 
 
 
288 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01661  quinate/shikimate 5-dehydrogenase, NAD(P)-binding  38.21 
 
 
288 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1908  quinate/shikimate dehydrogenase  37.86 
 
 
288 aa  174  1e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0693  shikimate 5-dehydrogenase  38.76 
 
 
271 aa  174  1e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0110194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0148  shikimate 5-dehydrogenase  37.74 
 
 
297 aa  173  3e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1490  shikimate 5-dehydrogenase  38.85 
 
 
286 aa  173  3e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0290047  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2356  shikimate 5-dehydrogenase  37.18 
 
 
283 aa  172  6e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.49241e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0022  shikimate dehydrogenase  36.3 
 
 
286 aa  172  7e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.301777  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0693  shikimate 5-dehydrogenase  39.15 
 
 
271 aa  171  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324204  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1962  shikimate 5-dehydrogenase  33.9 
 
 
315 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  38.68 
 
 
526 aa  170  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0108  shikimate 5-dehydrogenase  38.38 
 
 
289 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03620  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.29 
 
 
283 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0590963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6119  shikimate 5-dehydrogenase  38.15 
 
 
293 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.288801 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2848  shikimate 5-dehydrogenase  35.13 
 
 
301 aa  168  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1652  shikimate 5-dehydrogenase  41 
 
 
293 aa  168  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2467  shikimate 5-dehydrogenase  35.48 
 
 
288 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502359  hitchhiker  1.41391e-11 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0987  shikimate 5-dehydrogenase  41.16 
 
 
289 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1184  shikimate 5-dehydrogenase  39.45 
 
 
273 aa  168  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0070  shikimate 5-dehydrogenase  37.99 
 
 
296 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.909797  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2187  shikimate 5-dehydrogenase  37.16 
 
 
301 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1819  shikimate 5-dehydrogenase  39.48 
 
 
271 aa  166  3e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.244145 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2860  shikimate 5-dehydrogenase  36.74 
 
 
276 aa  166  3e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.928598  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2932  shikimate 5-dehydrogenase  39.05 
 
 
265 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00976663  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4481  shikimate 5-dehydrogenase  37.45 
 
 
288 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4417  shikimate 5-dehydrogenase  37.45 
 
 
288 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1385  quinate/shikimate dehydrogenase  36.1 
 
 
289 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.859901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2226  shikimate 5-dehydrogenase  42.34 
 
 
269 aa  166  6e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1564  shikimate 5-dehydrogenase  39.48 
 
 
283 aa  165  7e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3415  shikimate 5-dehydrogenase  39.11 
 
 
283 aa  165  7e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0361  shikimate 5-dehydrogenase  34.67 
 
 
298 aa  164  1e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0182  shikimate 5-dehydrogenase  34.67 
 
 
298 aa  164  1e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2721  shikimate 5-dehydrogenase  37.41 
 
 
286 aa  165  1e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1772  shikimate 5-dehydrogenase  39.49 
 
 
285 aa  164  2e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0689  shikimate 5-dehydrogenase  37.08 
 
 
285 aa  162  5e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1490  quinate/shikimate dehydrogenase  37.99 
 
 
288 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0135386 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1984  quinate/shikimate dehydrogenase  37.99 
 
 
288 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1813  quinate/shikimate dehydrogenase  37.99 
 
 
288 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.648856  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1455  quinate/shikimate dehydrogenase  37.99 
 
 
288 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.206578  normal  0.118327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1471  quinate/shikimate dehydrogenase  37.99 
 
 
288 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.75458  normal  0.0124621 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2016  shikimate 5-dehydrogenase  36.23 
 
 
283 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1368  shikimate 5-dehydrogenase  37.59 
 
 
271 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>