193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4378 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  100 
 
 		 212 aa  417  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  42.42 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  43.04 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  40.79 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  40.68 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  40 
 
 		 453 aa  126  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  41.63 
 
 		 452 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  41.92 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  41.99 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  37.6 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  41.38 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  43.56 
 
 		 447 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  41.41 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  39.46 
 
 		 258 aa  118  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  40.95 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  37.89 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  38.33 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  41.63 
 
 		 274 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  39.13 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  38.6 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  38.46 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  42.53 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  39.3 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  36.86 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  41.38 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  38.54 
 
 		 449 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  39.17 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  36.48 
 
 		 240 aa  104  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  37.45 
 
 		 248 aa  104  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  38.49 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  39.46 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  37.04 
 
 		 248 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  39.81 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  38.43 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  37.7 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  37.95 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  36.4 
 
 		 277 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  32.78 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  36.23 
 
 		 454 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  36.07 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  38.24 
 
 		 449 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  33.47 
 
 		 254 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  38.3 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  39.83 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  34.63 
 
 		 261 aa  95.9  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  38.74 
 
 		 250 aa  95.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  41.07 
 
 		 251 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  35.41 
 
 		 288 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  38.68 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  39.25 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  36.7 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33.19 
 
 		 246 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  32.33 
 
 		 244 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  33.75 
 
 		 274 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  33.75 
 
 		 274 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  40.68 
 
 		 241 aa  91.3  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  35.81 
 
 		 997 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  37.2 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  34.41 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  38.76 
 
 		 251 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  34.41 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  35.35 
 
 		 710 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  35.08 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  34.44 
 
 		 274 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  35.37 
 
 		 276 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  32.17 
 
 		 693 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  33.99 
 
 		 662 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  35.75 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  31.94 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  32.42 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  31.91 
 
 		 583 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  31.69 
 
 		 283 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  37.22 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  32.92 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  34.78 
 
 		 692 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  37.11 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  31.95 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  33.19 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  35.53 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  40.68 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  36.41 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  33.5 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  34.91 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  32.41 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  30.77 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  30.95 
 
 		 260 aa  81.6  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  35.35 
 
 		 255 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  35.2 
 
 		 689 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3979  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  41.04 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  33.5 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  33.74 
 
 		 288 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  34.69 
 
 		 287 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  34.78 
 
 		 299 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  33.33 
 
 		 279 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  31.6 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  31.22 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  33.04 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  29.66 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  29.84 
 
 		 680 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  32.91 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>