72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1896 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  59.89 
 
 		 203 aa  224  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  59.89 
 
 		 203 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  54.59 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  45.95 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  43.65 
 
 		 228 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  41.92 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  37.93 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  39.9 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  38.04 
 
 		 378 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  40.66 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  37.43 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  36.2 
 
 		 200 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  35.54 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  35.76 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  37.75 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  35.76 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  30.85 
 
 		 211 aa  97.8  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  31.14 
 
 		 390 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  29.06 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  29.06 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  30.06 
 
 		 398 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  31.95 
 
 		 367 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  27.23 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  29.87 
 
 		 247 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  30 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  28.24 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  26.92 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.34 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  29.07 
 
 		 369 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  28.28 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  29.17 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  26.6 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  24.62 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  27.78 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  27.15 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  28.92 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  29.52 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  27.08 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  31.94 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  24.28 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  24.42 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  26.37 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  23.84 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  27.59 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.65 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  22.09 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4622  hypothetical protein  25.77 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  26.13 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2009  putative lipoprotein  26.06 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1640  putative lipoprotein  29.85 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  26.85 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1821  putative lipoprotein  28.36 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  29.7 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 101 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  27.69 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0465  protein of unknown function DUF330  24.32 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  25.89 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  22.95 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  24.24 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  25 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  28.86 
 
 		 196 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  24.83 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  23.32 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>