57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1600 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  100 
 
 
964 aa  1990    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  36.7 
 
 
1003 aa  621  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  36.65 
 
 
979 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  35.81 
 
 
995 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  37.77 
 
 
979 aa  565  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  25.42 
 
 
934 aa  184  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  26.82 
 
 
936 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  25.1 
 
 
996 aa  169  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  25.82 
 
 
1001 aa  154  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  25.54 
 
 
1003 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  23.05 
 
 
967 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  22.85 
 
 
792 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  23.98 
 
 
982 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  22.59 
 
 
968 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  24.13 
 
 
961 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  24.75 
 
 
947 aa  102  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  23.05 
 
 
916 aa  102  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  22.62 
 
 
906 aa  100  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  23.49 
 
 
937 aa  98.2  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  22.37 
 
 
920 aa  89.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  22.35 
 
 
968 aa  87  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  21.34 
 
 
951 aa  86.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  21.98 
 
 
731 aa  86.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  23.42 
 
 
1008 aa  84.7  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  22.53 
 
 
892 aa  83.2  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  21.89 
 
 
933 aa  81.6  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.05 
 
 
703 aa  81.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  25.77 
 
 
747 aa  81.3  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.79 
 
 
737 aa  78.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  22.07 
 
 
878 aa  75.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  27.27 
 
 
894 aa  73.9  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  23.42 
 
 
561 aa  72.4  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  20.8 
 
 
751 aa  71.6  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  23.57 
 
 
1001 aa  72  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  22.91 
 
 
610 aa  71.2  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  21.61 
 
 
969 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  30.9 
 
 
848 aa  69.3  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  19.72 
 
 
911 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  19.72 
 
 
911 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  29.95 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  27.12 
 
 
651 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  24.32 
 
 
962 aa  64.7  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  23.19 
 
 
965 aa  63.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  24.47 
 
 
960 aa  60.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  22.27 
 
 
1106 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  21.09 
 
 
1279 aa  58.9  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  22.41 
 
 
1071 aa  57.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  54.35 
 
 
933 aa  57  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  20.3 
 
 
1012 aa  57  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  21.72 
 
 
1070 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  20.95 
 
 
969 aa  56.2  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  21.63 
 
 
852 aa  55.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  19.95 
 
 
1045 aa  55.1  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  48.89 
 
 
972 aa  52.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  22.95 
 
 
1118 aa  52  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  32.2 
 
 
745 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  51.43 
 
 
455 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>