More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3272 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3068  dienelactone hydrolase  64.94 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  47.11 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  46.43 
 
 		 237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2943  dienelactone hydrolase  45.13 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045049  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  37.44 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0293  dienelactone hydrolase  40.76 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  37.73 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  37.27 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2499  dienelactone hydrolase  37.27 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  33.07 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  35.07 
 
 		 318 aa  99  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  31.9 
 
 		 292 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  36.84 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 		 291 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 		 291 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.87 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  34.78 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  29.57 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  34.98 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  28.87 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  33.06 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  30.96 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  31.95 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  31.86 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  32.6 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  31.72 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.75 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  31.49 
 
 		 296 aa  89.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.75 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.75 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.86 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  28.87 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  34.36 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  28.08 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  32.26 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  32.02 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  28.99 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  33.92 
 
 		 238 aa  85.9  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  33.92 
 
 		 238 aa  85.9  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  29.11 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  32.22 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  31.93 
 
 		 296 aa  85.5  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  28.75 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  28.75 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  28.75 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  28.74 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  28.75 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  28.75 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  29.83 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  29.83 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  28.21 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  28.75 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  28.33 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  31.45 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  31.45 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  28.27 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  33.91 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  31.42 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  32.57 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  32.57 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  29.67 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  31.45 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  30.99 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  29.34 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  30.67 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  32.11 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  31.72 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  27.92 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  29.27 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  30.83 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  30.58 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  28.75 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  30.38 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  30.83 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  28.81 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  30.58 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  28.29 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  28.29 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  30.58 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>