67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1367 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1367  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  290  5e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000123372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0524  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0172488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3369  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0203998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1297  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 168 aa  42.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  28 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  28 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  28 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  28 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  28 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  28.12 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  28.12 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  28.12 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  28.12 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  28.12 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  28.12 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  28.12 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 157 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0464  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 153 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 161 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  28.12 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  24.73 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  26.17 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  20.18 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  26.17 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2216  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.103623  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 169 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 224 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  37.7 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 143 aa  40  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  28.07 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2905  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 146 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.607898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 149 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 157 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>