More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0689 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  99.45 
 
 
547 aa  1106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
544 aa  1111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  33.33 
 
 
532 aa  247  5e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  30.49 
 
 
538 aa  224  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  32.85 
 
 
513 aa  224  4e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  4.77414e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  31.59 
 
 
524 aa  223  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  31.39 
 
 
524 aa  220  4e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  31.39 
 
 
524 aa  220  4e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  31.53 
 
 
524 aa  220  4e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  31.39 
 
 
524 aa  220  4e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  31.6 
 
 
524 aa  220  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  31.17 
 
 
524 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  31.17 
 
 
524 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  31.17 
 
 
524 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  32.44 
 
 
526 aa  215  2e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3005  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  32.12 
 
 
488 aa  214  4e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1834  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.95 
 
 
523 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250373  hitchhiker  0.0023879 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  32.23 
 
 
526 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  32.23 
 
 
526 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.77 
 
 
544 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  5.91223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3342  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  32.33 
 
 
524 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  28.39 
 
 
549 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.9 
 
 
538 aa  201  4e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.76 
 
 
525 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.63 
 
 
524 aa  196  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  28.44 
 
 
530 aa  186  1e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2277  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding  30 
 
 
553 aa  181  3e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0883096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 
537 aa  175  2e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.88 
 
 
524 aa  174  3e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0020  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  27.47 
 
 
539 aa  169  8e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.75 
 
 
516 aa  165  2e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2372  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  30.7 
 
 
532 aa  165  2e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  28.86 
 
 
538 aa  163  8e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.44 
 
 
532 aa  163  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.44 
 
 
532 aa  163  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5619  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 
526 aa  157  5e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 
595 aa  157  5e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  31.23 
 
 
537 aa  156  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  33.81 
 
 
524 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  30.37 
 
 
537 aa  153  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  31.01 
 
 
541 aa  149  2e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  27.21 
 
 
527 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  27.25 
 
 
511 aa  147  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 
519 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  28.65 
 
 
551 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
544 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  33.55 
 
 
526 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.32073e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 
522 aa  143  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  32.54 
 
 
520 aa  143  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 
544 aa  143  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
512 aa  142  1e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  30.4 
 
 
528 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 
542 aa  141  4e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
536 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 
517 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 
528 aa  139  9e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  31.51 
 
 
545 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.57 
 
 
550 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.71 
 
 
565 aa  139  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.33 
 
 
524 aa  138  3e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  28.65 
 
 
551 aa  138  3e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 
529 aa  138  3e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  31.92 
 
 
537 aa  137  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.02 
 
 
511 aa  137  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
516 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  29.09 
 
 
560 aa  136  1e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  30.14 
 
 
515 aa  136  1e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 
535 aa  135  1e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
546 aa  135  2e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.1 
 
 
511 aa  135  2e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  31.1 
 
 
536 aa  135  2e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  28.53 
 
 
546 aa  135  2e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 
564 aa  135  2e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  32.09 
 
 
517 aa  135  2e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
546 aa  135  2e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.04 
 
 
510 aa  135  2e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  32.87 
 
 
533 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
537 aa  135  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  24.69 
 
 
562 aa  134  4e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 
516 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
567 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  27.14 
 
 
579 aa  134  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
526 aa  133  7e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  29.1 
 
 
503 aa  133  7e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  2.19856e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 
493 aa  133  1e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 
534 aa  132  1e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.11 
 
 
567 aa  132  1e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 
556 aa  131  2e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
534 aa  132  2e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  29.35 
 
 
580 aa  132  2e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.58 
 
 
520 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  28.69 
 
 
566 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.81 
 
 
535 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  30.93 
 
 
497 aa  131  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 
519 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
555 aa  131  4e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 
601 aa  131  4e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  30.23 
 
 
560 aa  130  7e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  28.11 
 
 
575 aa  130  9e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 
588 aa  130  9e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>