110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1214 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 732 aa  1510    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.48 
 
 		 421 aa  318  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  51.71 
 
 		 459 aa  291  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  51.71 
 
 		 459 aa  291  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.03 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  51.04 
 
 		 805 aa  281  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  45.02 
 
 		 810 aa  234  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  40.69 
 
 		 734 aa  229  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  39.51 
 
 		 781 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.44 
 
 		 683 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  42.76 
 
 		 609 aa  225  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  42.76 
 
 		 609 aa  225  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  33.97 
 
 		 700 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.42 
 
 		 822 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.12 
 
 		 743 aa  189  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.56 
 
 		 502 aa  184  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  44.08 
 
 		 655 aa  182  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  33.8 
 
 		 743 aa  181  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.45 
 
 		 729 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  43.12 
 
 		 587 aa  177  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  41.03 
 
 		 678 aa  173  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  36.7 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  30.88 
 
 		 853 aa  169  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  38.19 
 
 		 629 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.56 
 
 		 626 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  32.16 
 
 		 899 aa  165  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.39 
 
 		 698 aa  163  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  44.35 
 
 		 685 aa  157  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.51 
 
 		 754 aa  157  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.71 
 
 		 765 aa  157  9e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  43.93 
 
 		 691 aa  156  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.92 
 
 		 685 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  36.39 
 
 		 705 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  33.21 
 
 		 638 aa  152  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38 
 
 		 568 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  33.93 
 
 		 741 aa  148  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.15 
 
 		 590 aa  143  9e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.77 
 
 		 530 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  33.09 
 
 		 999 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  36.12 
 
 		 851 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.12 
 
 		 585 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  37.28 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  36 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.57 
 
 		 481 aa  127  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  35.38 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.59 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  45.76 
 
 		 845 aa  124  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  28.99 
 
 		 666 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  46.06 
 
 		 517 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  41.08 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  26.72 
 
 		 862 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  43.02 
 
 		 834 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  41.28 
 
 		 662 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  42.22 
 
 		 696 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.67 
 
 		 723 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  40.54 
 
 		 571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  39.88 
 
 		 900 aa  112  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  42.05 
 
 		 687 aa  110  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  42.86 
 
 		 722 aa  109  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  32.11 
 
 		 303 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  44.67 
 
 		 598 aa  104  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  38.98 
 
 		 605 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.94 
 
 		 603 aa  99.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  35 
 
 		 450 aa  97.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.3 
 
 		 449 aa  93.6  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  32.24 
 
 		 412 aa  92.8  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.88 
 
 		 510 aa  89.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.29 
 
 		 795 aa  87.4  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  30.65 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  26.62 
 
 		 597 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.68 
 
 		 410 aa  77  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.58 
 
 		 651 aa  75.5  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  27.19 
 
 		 513 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.02 
 
 		 530 aa  72.4  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  27.36 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  31.69 
 
 		 803 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.96 
 
 		 748 aa  66.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  24.12 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  33.91 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  28.27 
 
 		 524 aa  62  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3277  hypothetical protein  32.41 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  27.54 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  29.05 
 
 		 523 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  26.19 
 
 		 578 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  25.87 
 
 		 403 aa  55.1  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  24.46 
 
 		 589 aa  55.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 333 aa  54.3  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  21.72 
 
 		 714 aa  52.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  21.72 
 
 		 714 aa  52.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.34 
 
 		 559 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  35.64 
 
 		 333 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.95 
 
 		 559 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  25 
 
 		 578 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  25 
 
 		 847 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  25 
 
 		 843 aa  48.9  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.48 
 
 		 606 aa  48.5  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  25.52 
 
 		 792 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  26.67 
 
 		 342 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.64 
 
 		 668 aa  47.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  27.88 
 
 		 345 aa  47  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>