131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0526 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 344 aa  720    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  49.06 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  44.48 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  46.42 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  44.93 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  42.91 
 
 		 303 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  42.57 
 
 		 303 aa  255  7e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  43.29 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  40.53 
 
 		 296 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  39.78 
 
 		 283 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  43.45 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  43.16 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  41.3 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  39.16 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  41.44 
 
 		 315 aa  219  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  41.58 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  41.57 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  41.58 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  40.86 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  42.11 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  40.86 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  40.86 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  38.59 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  43.01 
 
 		 309 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  40.86 
 
 		 318 aa  208  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  40.5 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  42.66 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  38.81 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  38.35 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  41.49 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  39.22 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  38.77 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  38.33 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  40.33 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  38.77 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  38.87 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  35.81 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  38.33 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  38.65 
 
 		 323 aa  185  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  39.27 
 
 		 305 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  36.03 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  35.87 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  36.14 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  34.95 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  35.09 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  29.86 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  29.53 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1894  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.58 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703525  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.43 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  26.81 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  26.53 
 
 		 354 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 360 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 		 286 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  25.47 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 363 aa  52.8  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  26.79 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.7 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  29.17 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.32 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  21.69 
 
 		 351 aa  50.1  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  22.81 
 
 		 238 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  21.21 
 
 		 351 aa  49.3  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 348 aa  49.3  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  20.62 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  20.62 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  30.11 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.82 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0885  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  22.5 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  26.63 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0692  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  22.5 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.104164  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  28.03 
 
 		 243 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>