150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1372 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  59.25 
 
 		 312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  61.22 
 
 		 301 aa  354  8.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  57.89 
 
 		 305 aa  338  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  57.54 
 
 		 305 aa  335  5.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  58.6 
 
 		 313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  56.9 
 
 		 306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  54.45 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  58.82 
 
 		 336 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  53.17 
 
 		 301 aa  315  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  50.88 
 
 		 303 aa  305  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  55.14 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  50.87 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  49.13 
 
 		 308 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  50.87 
 
 		 318 aa  291  8e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  49.83 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  49.83 
 
 		 300 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  50.55 
 
 		 283 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  51.36 
 
 		 307 aa  285  7e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  51.69 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  45.76 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  50.94 
 
 		 302 aa  276  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  47.79 
 
 		 298 aa  265  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  46.58 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  46.05 
 
 		 334 aa  262  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  49.06 
 
 		 296 aa  261  8.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  48.73 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  45.94 
 
 		 373 aa  255  5e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  47.84 
 
 		 286 aa  255  8e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  47.84 
 
 		 286 aa  255  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  45.02 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  46.15 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  46.15 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  45.39 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  44.73 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  44 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  41.81 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  44.16 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  39.66 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  46.83 
 
 		 326 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 287 aa  231  9e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  41.38 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  42.52 
 
 		 373 aa  217  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  42.36 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  42.07 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  41.15 
 
 		 344 aa  199  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  42.91 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  39.86 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  42.52 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  38.31 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  35.25 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  35.56 
 
 		 326 aa  175  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  34.74 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  27.86 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1027  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.52 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.290473  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  29.62 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.73 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  29.74 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  30.07 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0313  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.94 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.331207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  31.72 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  31.52 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  30.73 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  26.49 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 365 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  39.58 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  32.76 
 
 		 365 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  23.63 
 
 		 354 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 326 aa  53.1  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  26.19 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 337 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 339 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 405 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 388 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  33.63 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  34.88 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  39.02 
 
 		 361 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  39.02 
 
 		 361 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>