144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1251 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  98.35 
 
 		 303 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  53.38 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  52.05 
 
 		 298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  48.99 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  43.45 
 
 		 321 aa  288  8e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  44.83 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  42.91 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  41.38 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  47.18 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  48.03 
 
 		 301 aa  254  9e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  41.08 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  44.73 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  41.81 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  42.81 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  45.85 
 
 		 287 aa  247  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  45.65 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  45.65 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  43.32 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  42.6 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  41.49 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  38.85 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  41.73 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  39.57 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  38.49 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  40.66 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  41.37 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  40.28 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  41.37 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  39.4 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  40.5 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  39.38 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  46.25 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  37.68 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  37.36 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  37.23 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  41.89 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  42.32 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  42.32 
 
 		 286 aa  201  9e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  42.32 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  38.06 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  36.96 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 		 373 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  35.51 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  34.89 
 
 		 371 aa  149  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  32.73 
 
 		 345 aa  145  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  32.74 
 
 		 374 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  31.69 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  30.68 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  26.42 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  27.45 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  24.27 
 
 		 345 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  28.71 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 363 aa  57  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 395 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 345 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  30.3 
 
 		 358 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  30.15 
 
 		 358 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 340 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  25.75 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  27.55 
 
 		 356 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 366 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  23.73 
 
 		 337 aa  52.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  23.23 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.62 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 348 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  24.36 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  27 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  26.02 
 
 		 356 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>