85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1701 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  612  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  67.61 
 
 		 287 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  57.34 
 
 		 320 aa  342  5e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  57.34 
 
 		 320 aa  342  5e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  50.9 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  47.78 
 
 		 298 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  44.16 
 
 		 313 aa  235  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  43.42 
 
 		 283 aa  225  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  42.09 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  42.05 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  40.21 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  42.18 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  40.79 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  41.38 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  41.89 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  41.89 
 
 		 303 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  42.24 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 319 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  40.64 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  41.52 
 
 		 318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  40.35 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  40.29 
 
 		 327 aa  211  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  40.96 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  42.24 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  42.6 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  38.59 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  38.31 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  42.11 
 
 		 301 aa  202  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  40.6 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  36.9 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  36.39 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 		 334 aa  191  9e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  36.24 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  37.55 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  37.01 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  36.88 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  38.31 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  37.02 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  33.44 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  37.98 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  33.67 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  36.43 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  33.77 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  34.22 
 
 		 373 aa  154  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  35.42 
 
 		 371 aa  152  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  34.22 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  34.22 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  32.92 
 
 		 373 aa  143  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  31.95 
 
 		 345 aa  132  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  30.81 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  31.95 
 
 		 333 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.36 
 
 		 238 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.84 
 
 		 247 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 364 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 377 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.63 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 384 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1027  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.71 
 
 		 242 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.290473  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.74 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  23.94 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  25.17 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.67 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.26 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  22.22 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.24 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  27.27 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1894  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.04 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703525  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  21.35 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>