119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2309 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 302 aa  624  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  95.33 
 
 		 309 aa  563  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  69 
 
 		 319 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  69 
 
 		 300 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  66.67 
 
 		 308 aa  428  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  64.67 
 
 		 300 aa  421  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  64.21 
 
 		 318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  52.35 
 
 		 301 aa  305  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  51.16 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  50.17 
 
 		 334 aa  296  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  49.51 
 
 		 334 aa  295  7e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  50.9 
 
 		 296 aa  292  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  49.28 
 
 		 306 aa  285  8e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  49.48 
 
 		 298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  47.97 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  49.45 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  48.3 
 
 		 305 aa  277  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  47.84 
 
 		 283 aa  276  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  45.85 
 
 		 312 aa  275  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  48.3 
 
 		 305 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  45.97 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  45.12 
 
 		 301 aa  265  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  45.86 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  46.4 
 
 		 313 aa  256  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  44.37 
 
 		 336 aa  254  9e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  44.64 
 
 		 323 aa  246  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  48.97 
 
 		 326 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  41.53 
 
 		 319 aa  245  6e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  46.38 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  41.22 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  41.37 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  41.01 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  42.86 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  41.37 
 
 		 373 aa  235  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  42.24 
 
 		 287 aa  235  9e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  42.55 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  42.55 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  42.11 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  42.6 
 
 		 295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  39.51 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  38.78 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  36.27 
 
 		 331 aa  192  8e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  37.5 
 
 		 326 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  39.24 
 
 		 374 aa  175  8e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  34.34 
 
 		 371 aa  159  7e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  36.08 
 
 		 372 aa  149  6e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  33.92 
 
 		 373 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  34.06 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  35.83 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  26.01 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  23.47 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  23.37 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 372 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  27.57 
 
 		 364 aa  53.1  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 356 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  28.22 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  24.25 
 
 		 348 aa  50.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31.67 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0189  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 344 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 		 376 aa  49.7  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 		 351 aa  49.3  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  24.81 
 
 		 353 aa  48.9  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  22.74 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  23.41 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  23.13 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 374 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  23.85 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  24.63 
 
 		 356 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  22.96 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  25.27 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>