118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1149 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  94.31 
 
 		 334 aa  667    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  90.72 
 
 		 334 aa  648    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  100 
 
 		 334 aa  698    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  49.21 
 
 		 319 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  49.35 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  50.5 
 
 		 300 aa  295  9e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  48.37 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  49.67 
 
 		 309 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  46.41 
 
 		 308 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  49.17 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  45.87 
 
 		 303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  46.76 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  44.22 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  48.84 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  48.14 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  47.57 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  46.05 
 
 		 298 aa  262  6e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  45.58 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  43.83 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  45.51 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  44.64 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  40.13 
 
 		 319 aa  248  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  44.52 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  45.13 
 
 		 326 aa  245  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  44.52 
 
 		 296 aa  245  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  43.19 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  42.95 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  42.7 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  39.4 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  38.69 
 
 		 303 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  41.96 
 
 		 283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  40.8 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  42 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  35.56 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  43.68 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  38.79 
 
 		 287 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  36.96 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  36.96 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  39.48 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  38.19 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  36.98 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  38.87 
 
 		 344 aa  192  8e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  37.01 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  37.83 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  35.87 
 
 		 321 aa  182  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  36.15 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  33.64 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  31.58 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 374 aa  136  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  33.89 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  33.56 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  32.44 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  23.75 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0189  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  23.69 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 286 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 376 aa  50.1  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  20.89 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  20.89 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 367 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  27.19 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  27.23 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  21.07 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  21.88 
 
 		 364 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  22.76 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  21.64 
 
 		 364 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 337 aa  46.2  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  33.04 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  29.8 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  22.06 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  22.44 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>