144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1956 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 301 aa  617  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  63.3 
 
 		 306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  61.22 
 
 		 298 aa  354  8.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  59.18 
 
 		 313 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  57.49 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  54.08 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  55.63 
 
 		 305 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  55.63 
 
 		 305 aa  322  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  48.5 
 
 		 303 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  54.18 
 
 		 312 aa  309  5e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  52.35 
 
 		 323 aa  308  8e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  50.53 
 
 		 319 aa  305  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  48.68 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  50.18 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  50.17 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  52.43 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  52.43 
 
 		 302 aa  295  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  47.2 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  54.35 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  54.35 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  47 
 
 		 300 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  47.28 
 
 		 318 aa  287  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  52.83 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  49.67 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  46.76 
 
 		 334 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  46.26 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  46.6 
 
 		 334 aa  269  4e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  49.26 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  46.13 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  45.02 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  45.35 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  51.67 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  43.01 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  42.6 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  42 
 
 		 319 aa  244  9e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  44.07 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  44.89 
 
 		 287 aa  241  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  45.99 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  45.99 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  43.98 
 
 		 373 aa  236  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  43.45 
 
 		 344 aa  226  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  41.76 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  40.69 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  40.96 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  38.3 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  37.85 
 
 		 331 aa  202  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  38.13 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  36.63 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  34.83 
 
 		 345 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  36.7 
 
 		 373 aa  167  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  35.62 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  38.75 
 
 		 373 aa  162  6e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  37.14 
 
 		 372 aa  156  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  27.02 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  30.24 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 388 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 		 351 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  24.25 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 363 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  23.51 
 
 		 364 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 		 384 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  25 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  32.8 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 344 aa  52.8  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0692  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.2 
 
 		 293 aa  52.4  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.104164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  28.9 
 
 		 365 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 405 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 366 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  30.41 
 
 		 362 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 363 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 360 aa  49.3  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 334 aa  48.9  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0654  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.05 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00347583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>