79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3602 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  100 
 
 		 345 aa  717    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  41.91 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  40.83 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  40.29 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  43.97 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  40.84 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  35.39 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  34.74 
 
 		 298 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  34.83 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  33.45 
 
 		 283 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 305 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  33.79 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  36 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  33.67 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  31.38 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  30.96 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  31.73 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  32.73 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  33.79 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  32.73 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  32.52 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  32.48 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  34.63 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  32.19 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  32.37 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  34.88 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  32.79 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  33.45 
 
 		 286 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  33.45 
 
 		 286 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  34.11 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  31.95 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  31.97 
 
 		 373 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  28.12 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 		 331 aa  108  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 362 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  23.44 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  24.55 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  22.5 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  21.72 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  22.07 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  22.73 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  21.85 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1903  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.378187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 314 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  21.35 
 
 		 345 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>