113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1072 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  63.3 
 
 		 301 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  57.14 
 
 		 313 aa  342  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  56.9 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  49.83 
 
 		 301 aa  318  7e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  53.33 
 
 		 336 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  51.32 
 
 		 303 aa  318  7.999999999999999e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  54.95 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  54.61 
 
 		 305 aa  311  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  51.34 
 
 		 323 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  51.16 
 
 		 312 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  48.98 
 
 		 307 aa  288  8e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  48.41 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  45.33 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  49.81 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 302 aa  278  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  47.14 
 
 		 312 aa  275  9e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  46.1 
 
 		 300 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  47.89 
 
 		 319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  49.28 
 
 		 286 aa  271  9e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  49.28 
 
 		 286 aa  271  9e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  45.23 
 
 		 308 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  46.6 
 
 		 318 aa  269  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  44.97 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  45.58 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  45.58 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  45.76 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  48.31 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  46.13 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  43.91 
 
 		 283 aa  248  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  45.86 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  43.98 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  40.81 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  41.48 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  42.01 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  42.01 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  46.95 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  39.85 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  38.1 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  40.33 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  41.56 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  36.52 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  36.88 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  37.92 
 
 		 374 aa  169  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  34.78 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 		 373 aa  152  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 		 355 aa  152  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  32.98 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  36.4 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  35.21 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  34.04 
 
 		 371 aa  143  5e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  29.48 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  25.09 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  24.91 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  26.01 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  24 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 345 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 344 aa  52.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.68 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 356 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  23.97 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  22.07 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0278  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  26.32 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  23.79 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 372 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 356 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 376 aa  46.2  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  23.22 
 
 		 370 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  27.54 
 
 		 356 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  22.88 
 
 		 361 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  22.88 
 
 		 361 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 363 aa  45.8  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  22.26 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  31.36 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>