139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0110 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 296 aa  617  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  59.25 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  47.57 
 
 		 315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  52.54 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  47.6 
 
 		 313 aa  302  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  48.99 
 
 		 303 aa  296  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  48.99 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  46.35 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  44.78 
 
 		 334 aa  251  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  43.77 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  44.97 
 
 		 320 aa  247  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  44.09 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  44.09 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  44.93 
 
 		 319 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  44.52 
 
 		 334 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  44.09 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  44.07 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  43.98 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  40.65 
 
 		 327 aa  241  7.999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  46.01 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  43.84 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  46.74 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  40.53 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  44.2 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  43.1 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  44.16 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  46.38 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  43.12 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  40.5 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  45.19 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  43.01 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  38.91 
 
 		 319 aa  226  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  42.35 
 
 		 312 aa  225  6e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  40.14 
 
 		 293 aa  225  9e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  41.7 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  41.76 
 
 		 313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  42.64 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  42.64 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  38.66 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  38.76 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  40.91 
 
 		 312 aa  215  8e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  40.35 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  42.28 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  35.08 
 
 		 331 aa  202  7e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  35.51 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 		 371 aa  162  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  36.46 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  34.53 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 		 373 aa  158  9e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  32.61 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 374 aa  149  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  25.8 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  25.56 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  25.56 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  25.27 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  24.59 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  24.28 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 356 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  23 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  25.26 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 355 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 355 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  27.05 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 362 aa  53.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 342 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 356 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 360 aa  52.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 351 aa  52.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.7 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  23.69 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  23.05 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.19 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  25.53 
 
 		 362 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  26.67 
 
 		 358 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  27.73 
 
 		 358 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  24.77 
 
 		 370 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  22.46 
 
 		 370 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  23.15 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>