92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2082 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  100 
 
 		 308 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  69.67 
 
 		 300 aa  441  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  69 
 
 		 319 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  65.33 
 
 		 300 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  66.11 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  66.67 
 
 		 302 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  65.89 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  51.62 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  47.2 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  49.13 
 
 		 298 aa  294  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  46.39 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  46.84 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  46.71 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  46.41 
 
 		 334 aa  285  9e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  46.41 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  45.27 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  47.86 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  49.66 
 
 		 305 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  47.48 
 
 		 298 aa  278  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  48.3 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  43.3 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  45.23 
 
 		 306 aa  269  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  46.43 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  44.22 
 
 		 312 aa  261  8e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  42.27 
 
 		 336 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  42.38 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  43 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  38.7 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  43.19 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  43.53 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  41.73 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  41.73 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  42.05 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  40.86 
 
 		 320 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  40.86 
 
 		 320 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  44.2 
 
 		 296 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  42.05 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  40.07 
 
 		 307 aa  221  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  37.46 
 
 		 373 aa  215  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  40.86 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  39.53 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  39.1 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  38.32 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  38.78 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  38.11 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  35.02 
 
 		 326 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  37.65 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  32.52 
 
 		 345 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  33.22 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  34.24 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  34.92 
 
 		 373 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  32 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 342 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  25.18 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  25 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  26.79 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  22.39 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  22.9 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 		 358 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 333 aa  45.8  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  22.52 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.97 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  27.65 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  24.82 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  22.95 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  30.82 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  22.93 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 339 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1397  pyruvate formate-lyase activating enzyme  32.31 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.559642 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  23.17 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 348 aa  42.4  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>