70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0661 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 320 aa  652    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  47.1 
 
 		 298 aa  268  8e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  44.55 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  42.38 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  43.33 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  44.97 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  45.26 
 
 		 283 aa  245  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  44.48 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  43.57 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  44.19 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  45.65 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  41.81 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  40.28 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  40.6 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  43.26 
 
 		 305 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  39.93 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  41.76 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  38.05 
 
 		 336 aa  225  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  41.32 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  43.67 
 
 		 334 aa  222  8e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  42.76 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  41.24 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  39.66 
 
 		 323 aa  219  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 302 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  42.52 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  42 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  44.31 
 
 		 303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  38.59 
 
 		 344 aa  210  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  39.05 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  37.76 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  39.36 
 
 		 319 aa  206  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  37.28 
 
 		 307 aa  205  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  35.91 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  37.34 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  38.59 
 
 		 295 aa  203  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  39.36 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  38.58 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  34.2 
 
 		 321 aa  186  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  37.31 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  37.31 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  35.22 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  32.9 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  35.52 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  33.45 
 
 		 372 aa  149  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 		 373 aa  149  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  30.96 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 374 aa  139  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  32.64 
 
 		 371 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  24.14 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 351 aa  49.7  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  27.98 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  22.18 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.17 
 
 		 236 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  25.64 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>