102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1488 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 323 aa  667    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  54.01 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  53.31 
 
 		 305 aa  318  9e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  53.4 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 301 aa  311  9e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  51.34 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  51.5 
 
 		 307 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  52.35 
 
 		 301 aa  308  9e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  55.14 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  49.17 
 
 		 313 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  49.51 
 
 		 312 aa  288  9e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  47.35 
 
 		 327 aa  287  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  43.93 
 
 		 373 aa  279  5e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  47.52 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  44.57 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  45.32 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  46.71 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  45.33 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  44.19 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  44.19 
 
 		 334 aa  248  7e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  47.02 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  44.09 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  45.33 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  41.49 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  43.19 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  45.55 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  43.19 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  40.13 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  40.78 
 
 		 303 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  44.24 
 
 		 296 aa  235  9e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  44.32 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  43.81 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  42.47 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  39.66 
 
 		 320 aa  219  7e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  36.76 
 
 		 319 aa  218  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  39.44 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  39.44 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  41.16 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  41.16 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 		 321 aa  199  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  38.33 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  38.65 
 
 		 344 aa  185  9e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  37.98 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  35.31 
 
 		 293 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  35.93 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 371 aa  162  7e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  34.49 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  37.37 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  36.33 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 		 372 aa  156  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 		 373 aa  149  6e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  33.79 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 405 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  26 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 366 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  27.23 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  25.79 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  29.33 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  22.47 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  24.68 
 
 		 364 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  26.67 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  25.45 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  21.89 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  31.45 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  28.8 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  26.42 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  25.69 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  25.9 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 356 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 351 aa  42.7  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>