178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0987 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 371 aa  773    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  76.22 
 
 		 372 aa  607  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  73.39 
 
 		 373 aa  596  1e-169  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  75.27 
 
 		 373 aa  588  1e-167  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  76.55 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  55.01 
 
 		 374 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  39.94 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  39.86 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  35.2 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 		 283 aa  176  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  36.82 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 		 305 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 		 312 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  35.62 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  37.41 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  37.18 
 
 		 296 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  38.06 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  35.74 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  36.62 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  35.46 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  36.11 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  35.42 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  34.55 
 
 		 302 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  36.11 
 
 		 315 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  34.89 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  35.12 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  34.53 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  33.58 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  35.45 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  33 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  34.04 
 
 		 306 aa  143  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  33.69 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  34.3 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  34.77 
 
 		 286 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 		 286 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  32.64 
 
 		 320 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  34.55 
 
 		 307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  35.99 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  33.68 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  30.63 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  33.57 
 
 		 344 aa  126  8.000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  32.4 
 
 		 326 aa  125  9e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  32.35 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  35.25 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  31.99 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  31.76 
 
 		 353 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  27.11 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  28.22 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  24.11 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  23.32 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  24.65 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  29.03 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.41 
 
 		 247 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  23.7 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  21.72 
 
 		 367 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 		 336 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 336 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 336 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 396 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.48 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  29.17 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  30.08 
 
 		 234 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  26.95 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>