111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2506 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 331 aa  687    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  40.21 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  40.94 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  37.58 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  39.53 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  37.34 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  37.85 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  35.08 
 
 		 296 aa  202  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  37.79 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  36.33 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  37.97 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  40.23 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  36.64 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  36.84 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  36.96 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  35.69 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  36.63 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  38.7 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  38.52 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  38.31 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  36.95 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  36.93 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  38.31 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  37.75 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  39.76 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  38.2 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  37.62 
 
 		 334 aa  185  7e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  37.83 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  38.4 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  35.56 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  33.44 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  38.71 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 327 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  34.39 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  35.93 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  32.31 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  34.66 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  35.92 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  33.77 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  35.34 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  34.63 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 		 372 aa  143  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  36.33 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  28.83 
 
 		 345 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0189  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 344 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  30.64 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  29.67 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  34.07 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  29.59 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  35.63 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  28.86 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 405 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 356 aa  49.7  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  32.53 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.12 
 
 		 243 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 396 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 337 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  26.83 
 
 		 354 aa  45.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 332 aa  46.2  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  34.15 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  29.03 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  35.37 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  25.13 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18280  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.17 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  32.11 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 337 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>