119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3220 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  100 
 
 
312 aa  642    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  54.45 
 
 
298 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  50.66 
 
 
312 aa  305  6e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  48.66 
 
 
301 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  48.36 
 
 
305 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  51.33 
 
 
313 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  49.01 
 
 
305 aa  296  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  52.36 
 
 
336 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  49.67 
 
 
301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  49 
 
 
307 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  47.52 
 
 
323 aa  278  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  47.14 
 
 
306 aa  275  9e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  44.22 
 
 
308 aa  261  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  42.9 
 
 
327 aa  259  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  46.98 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  44.22 
 
 
300 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  44.56 
 
 
319 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  43.2 
 
 
300 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  43.46 
 
 
318 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  46.21 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 
298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  39.81 
 
 
373 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  42.55 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  40.85 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  40.93 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  44.32 
 
 
286 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  44.32 
 
 
286 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  45.63 
 
 
309 aa  225  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  42.35 
 
 
296 aa  225  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  45.63 
 
 
302 aa  225  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  44.56 
 
 
326 aa  222  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  39.73 
 
 
320 aa  217  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  39.73 
 
 
320 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  38.81 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  38.06 
 
 
303 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  38.59 
 
 
334 aa  198  9e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  38.16 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  36.51 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  38.26 
 
 
334 aa  195  7e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  36.98 
 
 
334 aa  195  9e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  37.13 
 
 
287 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  38.52 
 
 
331 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 
319 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  35.22 
 
 
320 aa  183  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 
295 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  34.16 
 
 
293 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  33.22 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 
373 aa  158  9e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  34.58 
 
 
374 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
355 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  33.94 
 
 
372 aa  146  5e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 
373 aa  143  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  32.19 
 
 
345 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
371 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 
364 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 
365 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  27.55 
 
 
366 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 
369 aa  55.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  26.42 
 
 
336 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 
363 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  30 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 
382 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 
362 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 
367 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
333 aa  52.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  25.61 
 
 
370 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  25.69 
 
 
358 aa  50.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
376 aa  49.3  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 
360 aa  49.3  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 
356 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  24.9 
 
 
365 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  37.65 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  29.65 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 
351 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 
356 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 
337 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  26.03 
 
 
362 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 
367 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  34.88 
 
 
347 aa  45.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  25.77 
 
 
329 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 
343 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  31.08 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.7 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  25.82 
 
 
364 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.898506 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>