63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1949 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  652    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  53.05 
 
 		 287 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  50.9 
 
 		 295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  43.14 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  46.43 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  46.43 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  42.14 
 
 		 305 aa  261  8e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  43.23 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  42 
 
 		 300 aa  256  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  42.67 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  43 
 
 		 308 aa  252  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  40.76 
 
 		 334 aa  251  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  40.45 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  40.13 
 
 		 334 aa  248  8e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  41.06 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  42 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  40.43 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  43.01 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  42.33 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  42.14 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  40.49 
 
 		 315 aa  235  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  41.52 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  39.66 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  41.53 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  38.59 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  39.38 
 
 		 303 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  38.91 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  39.04 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  36.76 
 
 		 323 aa  218  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  38.85 
 
 		 303 aa  215  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  36.81 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  42.22 
 
 		 286 aa  210  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 		 326 aa  209  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  42.22 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  39.36 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  36.08 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  35.23 
 
 		 373 aa  199  7.999999999999999e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  32.54 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  35.81 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  32.35 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  33.44 
 
 		 321 aa  185  8e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  32.86 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  32.91 
 
 		 326 aa  176  7e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  32.31 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  33.69 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 373 aa  138  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  27.6 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  25 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0189  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0654  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.29 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00347583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  21.7 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  22.86 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  25.51 
 
 		 353 aa  42.4  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>