104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2121 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  679    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  50 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  51.67 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  46.23 
 
 		 334 aa  266  5e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  44.81 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  45.13 
 
 		 334 aa  258  9e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  44.74 
 
 		 336 aa  252  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  48.44 
 
 		 319 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  47.81 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  43.55 
 
 		 283 aa  248  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  43.58 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  43.62 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  48.97 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  44.06 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  40.32 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  40.32 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  43.81 
 
 		 323 aa  245  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  46.83 
 
 		 298 aa  245  9e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  48.62 
 
 		 309 aa  245  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  45.87 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  47.16 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  46.95 
 
 		 306 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  44.71 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  43.56 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  44.59 
 
 		 305 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  40.25 
 
 		 313 aa  238  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  45.76 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  42.76 
 
 		 320 aa  232  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  44.03 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  45.83 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  42.28 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  43.31 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  43.31 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  43.58 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  43.45 
 
 		 296 aa  219  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  42.66 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  40.65 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  39.35 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  38.8 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  38.6 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  35.9 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  36.6 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  36.43 
 
 		 295 aa  176  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  34.63 
 
 		 345 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  39.29 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  37.3 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  35.99 
 
 		 371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  37.7 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  29.87 
 
 		 362 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  26.06 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  23.83 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  24.48 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 367 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  24.36 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  27.38 
 
 		 370 aa  49.7  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  23.24 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  24.9 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  24.46 
 
 		 365 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  24 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  22.82 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  23.91 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  21.67 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  23.61 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  22.92 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  24.38 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  22.82 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  24.07 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  20.33 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  23.95 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  29.46 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 364 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>