More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0356 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  100 
 
 		 460 aa  954    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  46.84 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  45.31 
 
 		 408 aa  350  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  39.44 
 
 		 400 aa  289  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  39.44 
 
 		 400 aa  289  9e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  36.45 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  37.16 
 
 		 415 aa  266  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  36 
 
 		 414 aa  256  8e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  35.22 
 
 		 418 aa  250  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  37.09 
 
 		 414 aa  247  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  35.03 
 
 		 414 aa  233  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  33.92 
 
 		 419 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  34.8 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  33.04 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  32.6 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  32.82 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  32.95 
 
 		 404 aa  228  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  33.26 
 
 		 420 aa  226  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  34.65 
 
 		 407 aa  226  8e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  35.54 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  33.48 
 
 		 420 aa  222  9e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  33.63 
 
 		 409 aa  221  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  34.93 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  33.1 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  32.79 
 
 		 420 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  35.06 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  34.82 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  34.18 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  37.06 
 
 		 406 aa  211  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  37.39 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  33.18 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  32.41 
 
 		 418 aa  206  9e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  31.93 
 
 		 419 aa  202  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  32.79 
 
 		 403 aa  202  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  30.63 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  35.84 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  31.88 
 
 		 421 aa  197  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  31.02 
 
 		 404 aa  189  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  32.24 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  29.91 
 
 		 424 aa  187  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  29.91 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  31.06 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  30.23 
 
 		 403 aa  183  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  34.07 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  30.79 
 
 		 404 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  31.41 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  29.42 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  29.53 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  28.18 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  28.47 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  30.09 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  27.71 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  27.81 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  28.99 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  27.48 
 
 		 342 aa  114  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.05 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  27.55 
 
 		 341 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  27.46 
 
 		 341 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  25.93 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  25.12 
 
 		 343 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  24.57 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  27.72 
 
 		 346 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  27.09 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  28.85 
 
 		 340 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  25 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  26.78 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  28.57 
 
 		 341 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  27.34 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  27.54 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  27.8 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  27.91 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  24.81 
 
 		 366 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  27.7 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  28.04 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  29.48 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  28.64 
 
 		 344 aa  100  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  24.75 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  25.06 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0608  phosphofructokinase  26.98 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000647644  decreased coverage  0.00336631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  26.04 
 
 		 341 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  25.75 
 
 		 341 aa  97.4  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  27.69 
 
 		 350 aa  97.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  27.36 
 
 		 350 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  24.01 
 
 		 363 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  27.88 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  29.66 
 
 		 320 aa  93.6  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  23.85 
 
 		 359 aa  93.6  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  26.94 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0452  6-phosphofructokinase  25.38 
 
 		 339 aa  92.8  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.965208  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  24.03 
 
 		 360 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  24.57 
 
 		 372 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.42 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  26.25 
 
 		 343 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  23.39 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  29.41 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  23.88 
 
 		 368 aa  92  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  29.04 
 
 		 366 aa  91.3  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2681  phosphofructokinase  26.54 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3098  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.12 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>