More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3405 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 857 aa  1703    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3339  penicillin-binding protein 1A  76.6 
 
 		 895 aa  973    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.300992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  40.6 
 
 		 818 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  40.53 
 
 		 827 aa  570  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  41 
 
 		 797 aa  568  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  40.25 
 
 		 829 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  41.09 
 
 		 802 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  42.08 
 
 		 841 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  41.59 
 
 		 818 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  40.95 
 
 		 796 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  39.83 
 
 		 773 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  36.88 
 
 		 804 aa  533  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  40.91 
 
 		 778 aa  525  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  37.45 
 
 		 795 aa  510  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  40.22 
 
 		 852 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  38.66 
 
 		 807 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  39.05 
 
 		 807 aa  505  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  38.59 
 
 		 838 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  39.36 
 
 		 852 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  37.77 
 
 		 807 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  39 
 
 		 852 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  39.42 
 
 		 852 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  36.52 
 
 		 831 aa  478  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  37.16 
 
 		 862 aa  473  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  36.66 
 
 		 835 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  36.04 
 
 		 843 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.94 
 
 		 817 aa  466  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  36.11 
 
 		 831 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  34.36 
 
 		 814 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  37.22 
 
 		 809 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  35.58 
 
 		 819 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  34.11 
 
 		 815 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  34.77 
 
 		 817 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  35.16 
 
 		 817 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  36.4 
 
 		 830 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  36.82 
 
 		 830 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  34.51 
 
 		 819 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  35.56 
 
 		 830 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  36.36 
 
 		 804 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  35.48 
 
 		 830 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  34.27 
 
 		 814 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  36.28 
 
 		 777 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  36.61 
 
 		 819 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  36.48 
 
 		 832 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  34.95 
 
 		 819 aa  445  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  32.83 
 
 		 794 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  32.94 
 
 		 794 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  34.42 
 
 		 814 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  34.71 
 
 		 819 aa  445  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 833 aa  446  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  37.66 
 
 		 908 aa  445  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  34.46 
 
 		 817 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  34.11 
 
 		 823 aa  441  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  34.85 
 
 		 803 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  34.46 
 
 		 817 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  36.05 
 
 		 818 aa  442  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  35.73 
 
 		 817 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  36.37 
 
 		 807 aa  435  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  34.17 
 
 		 823 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 		 823 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  37.99 
 
 		 803 aa  430  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 797 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  34.58 
 
 		 818 aa  432  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  35.02 
 
 		 808 aa  432  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  35.27 
 
 		 846 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  33.14 
 
 		 844 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  35.27 
 
 		 840 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  36.26 
 
 		 793 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  35.27 
 
 		 840 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  33.37 
 
 		 844 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  35.27 
 
 		 840 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  33.22 
 
 		 793 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  33.66 
 
 		 846 aa  429  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  34.61 
 
 		 792 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  33.57 
 
 		 793 aa  429  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  33.37 
 
 		 844 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  35.03 
 
 		 852 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  34.16 
 
 		 771 aa  425  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  36.08 
 
 		 791 aa  425  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  34.9 
 
 		 805 aa  426  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  33.29 
 
 		 846 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  34.47 
 
 		 839 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  36.08 
 
 		 800 aa  426  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  35.11 
 
 		 840 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  34.63 
 
 		 801 aa  422  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  34.06 
 
 		 839 aa  422  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  35.11 
 
 		 840 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  34.69 
 
 		 840 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3394  penicillin-binding protein, 1A family  36.71 
 
 		 808 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.145767  normal  0.859795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 822 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0723  1A family penicillin-binding protein  34.98 
 
 		 866 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  33.95 
 
 		 839 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  33.83 
 
 		 839 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  34.89 
 
 		 810 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  36.32 
 
 		 778 aa  419  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  35.2 
 
 		 839 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  33.03 
 
 		 855 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 		 796 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  35.25 
 
 		 804 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  34.82 
 
 		 839 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>