More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3339 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3420  penicillin-binding protein, 1A family  96.64 
 
 
920 aa  1535    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0447054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3339  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 
895 aa  1767    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.300992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  70.1 
 
 
857 aa  1145    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3484  penicillin-binding protein, 1A family  96.06 
 
 
942 aa  1531    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0146326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  39.04 
 
 
797 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  39.08 
 
 
818 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  40.27 
 
 
829 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  40.07 
 
 
827 aa  555  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  40.35 
 
 
818 aa  551  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  39.84 
 
 
796 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  38.23 
 
 
841 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  41.75 
 
 
802 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  33.63 
 
 
823 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  33.63 
 
 
823 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 
814 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  33.67 
 
 
814 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 
817 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  35.39 
 
 
852 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  35.58 
 
 
852 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  35.45 
 
 
830 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  35.13 
 
 
852 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  35.1 
 
 
815 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  36.71 
 
 
807 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  34.16 
 
 
817 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1790  1A family penicillin-binding protein  36.13 
 
 
809 aa  435  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  34.18 
 
 
819 aa  435  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  33.93 
 
 
817 aa  436  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  34.09 
 
 
814 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  33.3 
 
 
803 aa  432  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1861  peptidoglycan glycosyltransferase  36.13 
 
 
854 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.894237  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  36.52 
 
 
800 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  33.52 
 
 
817 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  37.92 
 
 
804 aa  428  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  33.52 
 
 
817 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  40.53 
 
 
773 aa  426  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  35.16 
 
 
908 aa  426  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  31.48 
 
 
794 aa  422  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  35.18 
 
 
797 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  35.18 
 
 
797 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  31.48 
 
 
794 aa  419  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  33.56 
 
 
846 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  35.06 
 
 
797 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  32.21 
 
 
844 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  34.49 
 
 
797 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  39.46 
 
 
807 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  38.36 
 
 
795 aa  412  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  32.21 
 
 
844 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  32.21 
 
 
844 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  32.62 
 
 
822 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  32.55 
 
 
814 aa  412  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  35.15 
 
 
852 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  33.23 
 
 
849 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  35.15 
 
 
840 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  35.15 
 
 
846 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  35.15 
 
 
840 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  32.32 
 
 
793 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  32.44 
 
 
793 aa  405  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  35.32 
 
 
840 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  32 
 
 
839 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  35.15 
 
 
840 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  31.46 
 
 
843 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  35.27 
 
 
840 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  32.1 
 
 
839 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  35.27 
 
 
840 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  34.09 
 
 
837 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  31.67 
 
 
839 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  33.07 
 
 
833 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  33.11 
 
 
851 aa  399  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  34.02 
 
 
846 aa  398  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  31.56 
 
 
839 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  32.41 
 
 
855 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  34.18 
 
 
838 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  32.74 
 
 
845 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  32.62 
 
 
847 aa  399  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  33.11 
 
 
851 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  33.11 
 
 
851 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  33.52 
 
 
851 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  30.86 
 
 
804 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0723  1A family penicillin-binding protein  33.78 
 
 
866 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  32.56 
 
 
850 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  32.56 
 
 
850 aa  392  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  32.96 
 
 
858 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  32.41 
 
 
850 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  32.74 
 
 
850 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  32.74 
 
 
850 aa  392  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  37.59 
 
 
807 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  32.92 
 
 
796 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  36.77 
 
 
807 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  32.52 
 
 
850 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  32.41 
 
 
850 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  31.56 
 
 
846 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  32.56 
 
 
850 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  31.86 
 
 
850 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  31.68 
 
 
839 aa  389  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2085  penicillin-binding protein, 1A family  37.4 
 
 
904 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535891  normal  0.507146 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  32.63 
 
 
850 aa  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  33.18 
 
 
839 aa  389  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  32.63 
 
 
850 aa  389  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  34.09 
 
 
786 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  32.3 
 
 
850 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>