More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1863 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  100 
 
 		 166 aa  341  2e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  58.82 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  43.71 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 146 aa  117  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 147 aa  117  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  39.43 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  40.48 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  48.11 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  39.76 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  40.36 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  40.3 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  40.36 
 
 		 148 aa  111  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  40.67 
 
 		 166 aa  110  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  36.75 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  40.96 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 151 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  40.34 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  38.37 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  46.23 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  37.87 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  43.64 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  39.02 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  37.35 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  42.73 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  44.35 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  34.29 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  40.49 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  34.94 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  34.15 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  35.71 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  45.71 
 
 		 206 aa  101  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  45.87 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  45.67 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  34.15 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  40.48 
 
 		 192 aa  100  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 166 aa  100  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  37.21 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  39.44 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  41.94 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  37.2 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  47.27 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  37.21 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  35.15 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  43.31 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 188 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  38.4 
 
 		 137 aa  98.2  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  32.74 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 182 aa  97.4  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 146 aa  97.4  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  33.71 
 
 		 190 aa  97.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  37.57 
 
 		 167 aa  97.4  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 172 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 143 aa  97.4  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 173 aa  97.4  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  40 
 
 		 175 aa  97.1  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  39.16 
 
 		 156 aa  97.1  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  39.16 
 
 		 156 aa  97.1  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  47.62 
 
 		 136 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 242 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 182 aa  96.7  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 186 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  38.76 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  43.12 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  44.95 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  43.12 
 
 		 177 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  40.41 
 
 		 238 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  44.14 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  43.12 
 
 		 177 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  40.16 
 
 		 130 aa  94.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  36.53 
 
 		 151 aa  94.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  34.97 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  40.16 
 
 		 130 aa  94.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  43.12 
 
 		 185 aa  94.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 225 aa  94.4  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  43.12 
 
 		 185 aa  94.4  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  41.23 
 
 		 135 aa  94  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  37.28 
 
 		 164 aa  94  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  35.33 
 
 		 180 aa  94  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 161 aa  94  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  41.28 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  40.54 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>