More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2756 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 311 aa  630  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  98.07 
 
 		 311 aa  617  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  67.97 
 
 		 325 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  66.13 
 
 		 313 aa  407  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  59.06 
 
 		 343 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  63.52 
 
 		 299 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  63.38 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  67.11 
 
 		 307 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  54.87 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  53.14 
 
 		 297 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  52.49 
 
 		 305 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  51.15 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  52.49 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  52.96 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  52.01 
 
 		 296 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  51.68 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  51.68 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  51.68 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  51.68 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  51.68 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  51.68 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  51.34 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  51.01 
 
 		 296 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 296 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  51.68 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  50 
 
 		 294 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 296 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 296 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 296 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  51.37 
 
 		 339 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  49.5 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  42.53 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  42.23 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  40.45 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  40.98 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 		 289 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 327 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.72 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.14 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  26.67 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  26.51 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  29.02 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  28.32 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  29.93 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  24.17 
 
 		 2762 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  28.14 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  28.25 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  35.17 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  34.48 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  27.79 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1914  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  36 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5050  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  36.79 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5167  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  32.82 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0524  Alpha/beta hydrolase  46.58 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  26.5 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  26.95 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  25.99 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>